Pol II-H阻害剤

一般的なPol II-H阻害剤としては、α-Amanitin CAS 23109-05-9、DRB CAS 53-85-0、Triptolide CAS 38748-32-2、Flavopiridol CAS 146426-40-6およびCordycepin CAS 73-03-0が挙げられるが、これらに限定されない。

RNAポリメラーゼII（Pol II-H）の化学的阻害剤には、転写過程における酵素機能の様々な側面を標的とする多様な化合物が含まれる。α-アマニチンはそのような阻害剤の一つで、ヌクレオチド付加サイクルに関与する重要な構成要素であるRNAポリメラーゼIIのブリッジヘリックスに結合することによってその効果を発揮する。この結合は、DNA鋳型に沿ったRNAポリメラーゼIIの移動を妨げ、転写の伸長期を妨げる。同様に、DRBはC末端ドメイン（CTD）を標的とすることでPol II-Hの機能を損ない、転写の開始と伸長に必要なリン酸化事象を妨げる。Triptolideは、転写因子複合体TFIIHのXPBサブユニットに共有結合してATPアーゼ活性を阻害し、その結果、転写の開始を阻害するという異なるアプローチをとる。フラボピリドールは、転写の進行に不可欠な修飾であるPol II CTDのリン酸化に不可欠なサイクリン依存性キナーゼ（CDK）を阻害することによって作用する。

Pol II-Hの機能を阻害するその他の化合物としては、コルジセピンがある。コルジセピンは、新生RNA鎖に結合し、ヌクレオチドを模倣するが鎖伸長に必要な水酸基を欠くことにより、早期終結を誘導する。ICRF-193はトポイソメラーゼIIの活性を阻害する。トポイソメラーゼIIはDNAのスーパーコイルを調節する酵素で、Pol II-HがDNAを効果的に転写するための必要条件である。一方、アクチノマイシンDはDNAにインターカレートし、DNA鎖に沿った転写複合体の動きを物理的にブロックすることによって、Pol II-Hの進行を妨げる。BAY 11-7082は、Pol II-Hによってプロセシングされる遺伝子を制御する転写因子であるNF-κBの活性化を阻害し、間接的にPol II-Hの機能に影響を与える。カンタリジンは、プロテインホスファターゼ1および2Aを阻害し、CTDのリン酸化状態を変化させることにより、Pol II-Hの活性を阻害する。メイヤマイシンはPol II-Hの阻害剤であり、転写複合体に結合し、伸長中のRNA転写物の放出を妨げる。これらの化学物質はそれぞれ異なるメカニズムでPol II-Hの転写活性を阻害する。