PHKA1活性化物質には、細胞内シグナル伝達経路と相互作用し、最終的にその活性を増強させる様々な化合物が含まれる。例えば、ある種の低分子は、細胞内シグナル伝達に重要な二次メッセンジャーであるサイクリックAMP(cAMP)の産生を触媒する膜レセプターや酵素と直接相互作用することが知られている。これらの分子が結合すると、アデニル酸シクラーゼが活性化され、細胞内のcAMPレベルが上昇し、次にプロテインキナーゼA(PKA)が活性化される。PKAはPHKA1をリン酸化し、その活性化を促進する。さらに、cAMPの分解を阻害し、細胞内濃度を維持する化合物は、PKA活性を増加させ、PHKA1の活性にさらに影響を与える可能性がある。さらに、活性化因子の中には、アドレナリン作動性レセプターに結合し、cAMPの上昇とそれに続くPKAを介したPHKA1の活性化をもたらすカスケードを引き起こすものもある。
もう一つの活性化因子は、タンパク質を脱リン酸化し不活性化する酵素であるプロテインホスファターゼの活性を調節することによって作用する。これらのホスファターゼの阻害剤は、PHKA1の脱リン酸化を防ぎ、活性化されたリン酸化状態を維持する。他の活性化因子は、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3(GSK3)を阻害することで効果を発揮する。GSK3を阻害することにより、PHKA1の不活性化を防ぎ、持続的な活性を可能にする。さらに、AMPのアナログはAMP活性化プロテインキナーゼ(AMPK)を活性化し、細胞のエネルギーバランスに影響を与え、間接的にPHKA1の活性に影響を与えることができる。
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