MPP4の化学的活性化因子は、さまざまなシグナル伝達経路を通じて、その活性を調節する上で極めて重要な役割を果たしている。例えば、フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)は、プロテインキナーゼC(PKC)を直接活性化し、MPP4をリン酸化して細胞内シグナル伝達におけるその機能を高める。同様に、1-オレオイル-2-アセチル-sn-グリセロール(OAG)はジアシルグリセロール(DAG)を模倣してPKCアイソフォームを活性化し、MPP4をリン酸化する。イオノマイシンとカルシウムイオノフォアA23187は、ともに細胞内カルシウムレベルを上昇させ、カルモジュリン依存性プロテインキナーゼII(CaMKII)を活性化する。CaMKIIの活性化はMPP4のリン酸化につながる。さらに、フォルスコリンはアデニリルシクラーゼを活性化し、cAMPレベルを上昇させ、プロテインキナーゼA(PKA)を活性化し、MPP4のリン酸化と活性化につながる。
ある種の化学物質はMPP4の脱リン酸化を阻害し、活性状態を維持する。オカダ酸とカリクリンAは、タンパク質リン酸化酵素PP1とPP2Aの阻害剤であり、MPP4のリン酸化状態を維持する。さらに、8-ブロモアデノシン3',5'-環状一リン酸(8-Br-cAMP)およびN6-ベンゾイルアデノシン3',5'-環状一リン酸(6-Bnz-cAMP)は、PKAを活性化するcAMPアナログであり、MPP4を活性化する。タプシガルギンは、サルコ/小胞体Ca²⁺-ATPアーゼ(SERCA)を阻害することによりカルシウムのホメオスタシスを破壊し、その結果、細胞質カルシウムレベルが上昇し、CaMKIIなどのキナーゼを活性化し、続いてMPP4の活性化につながる。一方、BIM(Bisindolylmaleimide I)は、PKCを阻害するが、PKCの基底活性につながるコンフォメーションを誘導することもでき、MPP4の活性化をもたらす。
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