MAGE-B18阻害剤には、主に遺伝子発現のエピジェネティック制御を標的とする様々な化合物が含まれる。これらの阻害剤は、ヒストンのアセチル化状態を変化させることによって作用し、その結果、クロマチン構造と転写装置のDNAへのアクセス性に影響を与える。ヒストン脱アセチル化酵素(HDAC)阻害剤は、ヒストンのアセチル化を亢進させることでMAGE-B18の発現を低下させると考えられている。ヒストンのアセチル化が進むと、クロマチン構造がよりオープンになり、MAGE-B18のような、組織特異的に発現制御される遺伝子の発現が抑制される可能性がある。これらの化合物によるエピジェネティクスの変化により、MAGE-B18の発現が低下し、その機能的活性が阻害される可能性がある。
HDAC阻害剤と並んで、DNAメチル化酵素阻害剤もMAGE-B18の阻害に関与している。これらの化合物はDNAのメチル化を低下させ、MAGE-B18を含む腫瘍特異的抗原の発現を低下させる可能性がある。メチル化レベルの低下は、がんの進行や免疫回避に関与する遺伝子を含む、幅広い遺伝子の発現パターンに変化をもたらす可能性がある。DNAのメチル化状態に影響を与えることにより、これらの阻害剤はMAGE-B18の存在低下に寄与し、発癌におけるその役割に影響を与える可能性がある。
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