KIAA1305という遺伝子によってコードされるタンパク質が同定され、その特徴が明らかにされた場合、このタンパク質を標的とする阻害剤の開発には、そのタンパク質の構造と細胞内での役割を理解するための集中的な研究努力が必要となる。そのためには、タンパク質のアミノ酸配列、三次構造、機能ドメインを明らかにする必要がある。バイオインフォマティクスのアルゴリズムのような研究ツールは、配列の相同性に基づいて構造や可能性のある機能を予測することができる。一方、X線結晶構造解析、NMR分光法、クライオ電子顕微鏡法などの経験的な方法は、タンパク質の3次元構造に関する直接的な洞察を提供するだろう。構造データが手に入れば、科学者たちは、低分子阻害剤のターゲットに適した潜在的な結合ポケットや活性部位を特定することができるだろう。
このような結合部位の同定により、KIAA1305タンパク質の活性を調節するような形で相互作用しうる分子を設計するための標的アプローチが可能になる。化合物ライブラリーを含むスクリーニングプロセスは、タンパク質に親和性を示す最初の分子を発見するために利用できる。ハイスループットスクリーニング技術により、タンパク質との相互作用について何千もの化合物を迅速にテストすることができ、潜在的なリード化合物の同定につながる。これらのリード化合物のその後の最適化は、その特異性と結合強度の向上に焦点を当てることになる。構造活性相関(SAR)研究はこのプロセスで重要な役割を果たし、タンパク質との相互作用を強化するために化学構造を修正する際に医薬品化学者を導く。コンピューター支援薬物設計(CADD)は、さまざまな化学修飾が阻害剤の結合にどのような影響を与えるかをシミュレーションすることで、経験的手法を補完することができる。この反復プロセスは、KIAA1305タンパク質と確実かつ特異的に相互作用する化合物を開発することを目的とし、それによってタンパク質の機能をさらに研究するための一連の分子ツールを提供することになる。
関連項目
製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
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Raltegravir | 518048-05-0 | sc-364600 sc-364600A sc-364600B sc-364600C sc-364600D | 5 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g | $100.00 $821.00 $1229.00 $2861.00 $4085.00 | 21 | |
レトロウイルスのインテグラーゼの活性部位に結合して阻害し、同様のドメインを持つタンパク質を阻害する可能性がある。 | ||||||
3′-Azido-3′-deoxythymidine | 30516-87-1 | sc-203319 | 10 mg | $60.00 | 2 | |
逆転写を阻害するヌクレオシドアナログは、間接的にレトロウイルス過程に関与するタンパク質に影響を与えるかもしれない。 | ||||||
Edoxaban | 480449-70-5 | sc-483508 | 25 mg | $522.00 | ||
抗凝固剤としては、第Xa因子を阻害する。もしNYNドメイン・タンパク質が同じメカニズムを持っているならば、その類似性からNYNドメイン・タンパク質を阻害する可能性がある。 | ||||||
S/GSK1349572 | 1051375-16-6 | sc-364605 sc-364605B sc-364605A | 5 mg 50 mg 200 mg | $367.00 $1484.00 $4131.00 | ||
HIVインテグラーゼを特異的に阻害し、他のタンパク質にも同様のドメインが存在する可能性がある。 | ||||||
Nevirapine | 129618-40-2 | sc-208092 | 5 mg | $97.00 | 5 | |
非ヌクレオシド系逆転写酵素阻害剤であり、間接的にレトロウイルスのアセンブリー/プロセシングのタンパク質に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Efavirenz | 154598-52-4 | sc-207612 | 10 mg | $168.00 | 3 | |
もう一つの非ヌクレオシド系逆転写酵素阻害剤で、レトロウイルスや関連タンパク質のプロセシングに二次的な影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Ribavirin | 36791-04-5 | sc-203238 sc-203238A sc-203238B | 10 mg 100 mg 5 g | $62.00 $108.00 $210.00 | 1 | |
ヌクレオチド合成を阻害する抗ウイルス薬で、RNA結合タンパク質やプロセシングタンパク質に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Sofosbuvir | 1190307-88-0 | sc-482362 | 25 mg | $143.00 | 1 | |
C型肝炎ウイルスのRNAポリメラーゼを阻害するヌクレオチドアナログ;他のタンパク質の類似ドメインに標的外作用を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Lopinavir | 192725-17-0 | sc-207831 | 10 mg | $129.00 | 6 | |
HIVプロテアーゼ阻害剤で、プロテアーゼ様ドメインを持つ他のタンパク質にも影響を及ぼす可能性がある。 |