IRX1の化学的阻害剤は、心筋構造の発生と維持におけるIRX1の役割に重要な、さまざまな細胞内シグナル伝達経路を通じて、IRX1の機能を効果的に阻害することができる。Rho関連タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤であるY-27632は、平滑筋細胞の収縮とアクトミオシン収縮性を阻害する。これらは、心臓組織形成におけるIRX1の適切な機能に不可欠である。同様に、SB431542はTGF-βタイプI受容体ALK5を標的とし、この受容体を阻害することによってTGF-βシグナル伝達経路を破壊する。この経路は心臓の分化と形態形成に不可欠であり、IRX1が重要な役割を果たしている。もう一つの阻害剤U0126は、MEK1/2を選択的に阻害し、MAPK/ERK経路を障害する。IRX1はMAPK/ERKシグナルによって制御される発生経路に関与していることから、この経路の阻害はIRX1の機能阻害につながる可能性がある。
さらに、LY294002とWortmanninはともにPI3K阻害剤として作用し、IRX1が関与する細胞増殖と生存に重要な経路であるPI3K/Aktシグナル伝達経路の破壊につながる。DorsomorphinとLDN-193189は、それぞれAMPKとBMP I型受容体ALK2とALK3を阻害することで、IRX1が関与する発生過程に重要なもう一つの経路であるBMPシグナル伝達を阻害する。JNK経路阻害剤であるSP600125とSrcファミリーキナーゼ阻害剤であるPP2は、発生を含む様々な細胞過程に関与する経路を阻害し、IRX1の機能阻害につながる可能性がある。さらに、FGFR阻害剤であるSU5402とPD173074は、IRX1が関与する発生過程に重要な線維芽細胞増殖因子シグナル伝達を阻害する。これらの経路の阻害は、IRX1がこれらのプロセスで果たす役割を妨害し、機能阻害につながる可能性がある。
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