IGFL3は、多様な細胞内シグナル伝達経路に関与して、このタンパク質の活性を調節することができる。フォルスコリンはアデニルシクラーゼを直接刺激する化合物で、細胞内のcAMPレベルを上昇させ、プロテインキナーゼA(PKA)の活性化につながる。PKAは次に、様々なタンパク質をリン酸化することができ、もしIGFL3がPKAの基質プロファイルに該当すれば、IGFL3もリン酸化される可能性がある。同様に、細胞透過性のcAMPアナログであるジブチリル-cAMP(db-cAMP)もPKAを活性化することができ、その結果、IGFL3がリン酸化され、活性化される可能性がある。(-)-イソプロテレノール塩酸塩は、β-アドレナリン受容体アゴニストとして機能し、cAMPレベルを上昇させ、同様にPKA活性化をもたらし、IGFL3活性に影響を与える可能性がある。
PDBu(ホルボール12,13-ジブチレート)は、プロテインキナーゼC(PKC)を活性化する。PKCは、様々なタンパク質をリン酸化するが、もしIGFL3がPKCの基質であれば、IGFL3もリン酸化される可能性がある。イオノマイシンは、細胞内カルシウムレベルを上昇させることにより、カルモジュリン依存性キナーゼ(CaMK)などのカルシウム依存性キナーゼ経路を開始し、IGFL3をリン酸化する可能性がある。インスリンは、その受容体を介して、ホスホイノシチド3-キナーゼ(PI3K)とAKTを含むカスケードを引き起こし、それが下流のエフェクターであれば、IGFL3の活性化につながる可能性がある。上皮成長因子(EGF)は、その受容体を刺激してMAPKとPI3K-AKT経路の両方を活性化し、IGFL3に影響を与える可能性がある。タンパク質合成阻害剤として知られるアニソマイシンは、JNKのようなストレス活性化タンパク質キナーゼも活性化し、ストレス応答シグナル伝達においてIGFL3を標的とする可能性がある。カリクリンAと岡田酸は、どちらもタンパク質リン酸化酵素PP1とPP2Aの阻害剤であるが、脱リン酸化を防ぐことによって、IGFL3をリン酸化された、つまり活性化された状態に維持する可能性がある。最後に、塩化リチウムはグリコーゲン合成酵素キナーゼ3(GSK-3)を阻害することから、Wntシグナル伝達経路の活性化につながる可能性があり、もしIGFL3がこの経路やGSK-3によって制御されるタンパク質と関連していれば、IGFL3の活性化に関与する可能性がある。
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