IFT20を間接的に阻害することができる化合物群は、繊毛形成と繊毛の機能に不可欠な様々な細胞構造とシグナル伝達経路を標的とすることで、それを実現している。IFT20は、IFT複合体の一部であり、繊毛や鞭毛に沿った双方向の輸送に重要であり、それらの組み立てと維持に必要である。従って、繊毛形成の阻害や繊毛機能の障害は、IFT20活性を阻害する間接的な方法として役立つ。ノコダゾール、コルヒチン、グリセオフルビン、デメコルシン、メベンダゾールなどの微小管標的薬剤は、微小管の重合と安定性を阻害する。繊毛は微小管ベースの軸索から構成されているため、これらの化合物は適切な繊毛の形成や機能を停止させ、それによってこの細胞構造内でのIFT20の役割に影響を与える可能性がある。チトカラシンDは、アクチンフィラメントへの作用を通して、微小管とアクチン細胞骨格の間の協調的な作用を必要とするプロセスである繊毛形成を阻害する可能性もある。
一方、シリオブレビンDやフォルスコリンのような化合物は、繊毛形成の開始と制御に重要なシグナル伝達経路を破壊する。シリオブレビンDは繊毛の形成に関与することが知られているヘッジホッグシグナル伝達経路を阻害し、一方、フォルスコリンのcAMPレベルの上昇は繊毛の形成を阻害することが示されている。MHY1485はmTOR活性化剤として、細胞増殖に関与する重要なシグナル伝達経路に影響を与え、繊毛形成に影響を与える可能性がある。タプシガルギンとゼブラリンは異なるメカニズムで作用する。タプシガルギンはカルシウムのホメオスタシスを破壊し、これは重要であるIFT20阻害剤は、定義された化学的分類ではなく、タンパク質の活性に重要なプロセスや構造を標的とすることにより、間接的にIFT20の機能に影響を与えることができる様々な化合物の集合体である。これらの阻害剤は、IFT20が重要な役割を果たすことが知られている繊毛形成、あるいは繊毛の安定性と機能を阻害するために、それぞれ異なるメカニズムで作用する。IFT20が繊毛の形成と維持に寄与する鞭毛内輸送系に必須であることから、繊毛の形成や機能を阻害する化合物は、IFT20の間接的な阻害剤として機能する可能性がある。
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