GMDの化学的活性化因子は、様々な生化学的経路を通じてタンパク質に影響を与えるが、主にタンパク質の活性を制御する一般的なメカニズムであるリン酸化状態を変化させることによって影響を与える。例えば、オルソバナジン酸ナトリウムは、タンパク質チロシンホスファターゼを阻害する。この阻害によってタンパク質の脱リン酸化が妨げられ、その結果GMDのリン酸化状態が維持または増加し、活性が増強される可能性がある。同様に、カリンクリンAやオカダ酸は、PP1やPP2Aのようなタンパク質リン酸化酵素の阻害剤として機能し、GMDの脱リン酸化を阻害することで、GMDを活性化状態に保つことができる。
フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)はプロテインキナーゼC(PKC)を特異的に活性化し、PKCはGMDをリン酸化してその活性を上昇させる。この活性化経路は、フォルスコリンやジブチリル-cAMPのような他の活性化因子にも共通し、どちらも細胞内のcAMPレベルを上昇させ、それによってPKAを活性化し、GMDをリン酸化する。イオノマイシンはカルシウム依存性の機序で作用し、細胞内カルシウム濃度を上昇させ、GMDをリン酸化し活性化するカルシウム依存性キナーゼを活性化する。アニソマイシンは、GMDをリン酸化の標的とするストレス活性化プロテインキナーゼの活性化を通じて作用し、GMDの活性を高める。化合物6-ベンジルアミノプリンはサイクリン依存性キナーゼを活性化し、このキナーゼもGMDを標的としてリン酸化と活性化を引き起こす。LY294002とラパマイシンは、それぞれPI3KとmTORの阻害剤として知られているが、GMDを直接リン酸化し活性化しうる他のキナーゼの代償的活性化をもたらしうる。最後に、ホスファチジン酸はmTORを活性化し、GMDのリン酸化と活性化に関与する下流のキナーゼに影響を与える可能性があり、GMDの活性を制御する上で、これらの細胞内シグナル伝達経路が相互に関連していることを強調している。
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