最初のHTSに続いて、同定された候補化合物は、Gγ4に対する特異性と直接的な効果を確認するために、より洗練された一連のアッセイに供される。これらの二次的なアッセイには、表面プラズモン共鳴や等温滴定カロリメトリーなどの直接的な結合試験が含まれ、Gγ4タンパク質と候補活性化物質との間の物理的相互作用を確認することができる。さらに、タンパク質の機能に対する化合物の正確な効果を決定するために、さらなる生化学的アッセイも実施されるであろう。直接的な相互作用が確認されれば、詳細な構造研究を行うことができる。X線結晶構造解析、NMR分光法、クライオ電子顕微鏡法などの技術を用いて、活性化物質と複合体化したGγ4タンパク質の三次元構造を決定し、活性化メカニズムの分子的詳細を明らかにすることができるだろう。
このような構造的洞察は、より強力で特異的な活性化剤分子の合成の指針になるだろう。活性化剤の結合部位や、結合時に誘導されるGγ4の構造変化に関する正確な情報が得られるからである。これらの実験技術を補完するものとして、計算モデリングと分子動力学シミュレーションは、活性化因子がGγ4と原子レベルでどのように相互作用するかについての予測を提供し、活性化プロセスを理解し、タンパク質の活性を調節する上でより有効な改良化合物を設計するために極めて重要である。
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