FANK1の化学的阻害剤は、FANK1が関与することが知られているシグナル伝達経路を標的とすることにより、様々なメカニズムで機能阻害を達成することができる。幅広いタンパク質キナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、FANK1の機能にとって重要なステップである基質のリン酸化を阻害することにより、FANK1のキナーゼ活性を阻害することができる。同様に、アデノシンキナーゼ阻害剤である5-ヨードツベルシジンは、アデノシンのリン酸化を阻害し、FANK1の働きを阻害する可能性がある。PI3K阻害剤であるLY294002とWortmanninは、PI3K/Aktシグナル伝達経路を抑制することができる。MAPキナーゼ経路のMEKを標的とするPD98059とU0126は、FANK1の活性化を防ぐことができる。
さらに、SP600125はJNK阻害剤として働き、FANK1を機能的に阻害することができる。SB203580は、p38 MAPキナーゼを阻害することにより、FANK1の活性を阻害することができる。mTOR阻害剤であるラパマイシンは、FANK1の機能を抑制することができる。Srcファミリーキナーゼを阻害するPP2は、Srcキナーゼシグナル伝達を阻害し、FANK1活性に影響を及ぼす。最後に、EGFRチロシンキナーゼを特異的に阻害するゲフィチニブは、FANK1の活性を阻害するであろう。
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