概説したように、DDX31活性化因子は、RNA代謝、細胞エネルギー、転写ランドスケープにおいて役割を果たしている。例えば、ベツリン酸はATPレベルを高めることにより、DEAD-boxヘリカーゼがATPに依存していることを考えると、DDX31のRNA巻き戻し能を高めることができる。db-cAMPやフォルスコリンなどの化合物は、細胞内のcAMPを上昇させ、ヘリカーゼに依存するプロセスを誘発する可能性がある。同様に、AMPK活性に対するAICARの効果や、RNA合成に対するD-リボースの直接的な影響も、RNAヘリカーゼの必要性を強調していると思われる。
エトポシドのようなDNA損傷剤は、間接的にRNA修復機構の必要性を高める可能性があり、DDX31の関与が示唆される。スルフォラファン、BAY11-7082、ダイゼイン、フマル酸ジメチルなどの薬剤で転写環境を変化させると、遺伝子発現が変化してもRNAの忠実性を維持するために、RNAヘリカーゼ活性の亢進が要求されるかもしれない。このような化合物は、間接的なモジュレーターがDDX31のようなタンパク質の機能にどのような影響を与えることができるかを示す顕著な例であり、細胞の経路と機構が織り成す性質を強調している。
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