DDX12阻害剤は、DDX12タンパク質を標的とし、その作用を阻害するように特別に設計された化学物質のユニークなカテゴリーに属する。DDX12は、別名DEAD-boxヘリカーゼ12として知られ、RNAヘリカーゼのDEAD-boxファミリーのメンバーである。これらのヘリカーゼは、リボソームの生合成、RNAスプライシング、RNA輸送、RNA崩壊、翻訳開始など、RNA代謝の様々な局面で重要な役割を果たしている。DEAD-boxヘリカーゼは、そのタンパク質配列に見られる保存されたAsp-Glu-Ala-Asp(DEAD)モチーフに由来する。このモチーフは、他の保存されたモチーフとともに、これらのヘリカーゼがATP依存的にRNAを結合し、巻き戻すのを助ける。
DDX12阻害剤は、その名が示すように、DDX12タンパク質の機能を特異的に阻害し、それによってRNA代謝におけるその役割を調節する。これらの阻害剤の特異的な作用機序は、多くの場合、ATP結合部位の破壊、タンパク質のATPアーゼ活性の障害、あるいはDDX12のRNA結合領域の妨害を伴う。そうすることで、これらの化合物は、DDX12が極めて重要な役割を果たしている細胞プロセスを著しく変化させることができる。RNAヘリカーゼが細胞内プロセスに広く関与していることを考えると、DDX12を標的とするような阻害剤を通して、その作用を理解し、調節することは、基本的な生物学的プロセスと分子動力学に関する貴重な洞察を提供することができる。
| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
Quercetin | 117-39-5 | sc-206089 sc-206089A sc-206089E sc-206089C sc-206089D sc-206089B | 100 mg 500 mg 100 g 250 g 1 kg 25 g | $11.00 $17.00 $108.00 $245.00 $918.00 $49.00 | 33 | |
抗酸化作用を持つフラボノイドであるケルセチンは、DDX12のATP結合ポケットに結合することでDDX12を阻害し、その巻き戻し活性を阻害するのかもしれない。 | ||||||
Ellagic Acid, Dihydrate | 476-66-4 | sc-202598 sc-202598A sc-202598B sc-202598C | 500 mg 5 g 25 g 100 g | $57.00 $93.00 $240.00 $713.00 | 8 | |
RNAやタンパク質と相互作用することが知られているエラグ酸は、DDX12のRNA結合部位やATP結合部位に影響を与え、ヘリカーゼ活性を阻害する可能性がある。 | ||||||
GSK-3 Inhibitor XVI | 252917-06-9 | sc-221691 sc-221691A | 5 mg 25 mg | $153.00 $520.00 | 4 | |
主な標的はRNAヘリカーゼではないが、DDX12が間接的に影響を受ける下流への影響があるかもしれないし、DDX12に直接オフターゲット効果があるかもしれない。 | ||||||
CCG 203971 | 1443437-74-8 | sc-507360 | 10 mg | $89.00 | ||
もしDDX12と相互作用するならば、おそらくATP結合部位を標的にして、ヘリカーゼ活性に不可欠なATPの加水分解を妨げる。 | ||||||
TBB | 17374-26-4 | sc-202830 sc-202830A sc-202830C sc-202830B sc-202830D | 10 mg 25 mg 50 mg 100 mg 250 mg | $240.00 $363.00 $445.00 $760.00 $1781.00 | 17 | |
この分子は、ATP結合ポケットに結合することでDDX12を阻害し、エネルギー駆動型のRNAの巻き戻しを阻止するのかもしれない。 | ||||||
Fluorouracil | 51-21-8 | sc-29060 sc-29060A | 1 g 5 g | $36.00 $149.00 | 11 | |
主に代謝拮抗剤であるが、DDX12への潜在的な影響は、RNAへの取り込みによって巻き戻しの基質となりにくくなること、あるいは他の間接的な細胞内メカニズムによるものである可能性がある。 | ||||||
3′-Azido-3′-deoxythymidine | 30516-87-1 | sc-203319 | 10 mg | $60.00 | 2 | |
主に逆転写酵素を標的とする。DDX12を阻害するとすれば、RNA基質に取り込まれるか、ATP結合部位を競合することによって阻害するのかもしれない。 | ||||||
Suramin sodium | 129-46-4 | sc-507209 sc-507209F sc-507209A sc-507209B sc-507209C sc-507209D sc-507209E | 50 mg 100 mg 250 mg 1 g 10 g 25 g 50 g | $149.00 $210.00 $714.00 $2550.00 $10750.00 $21410.00 $40290.00 | 5 | |
この化合物はポリアニオン性であるため、DDX12のRNAあるいはATP結合部位に干渉し、ヘリカーゼ活性を阻害する可能性がある。 | ||||||