C6orf103の化学的阻害剤は、細胞プロセスを制御する主要な酵素や受容体を選択的に標的化し阻害することにより、様々な細胞内シグナル伝達経路を通して機能する。ホスファチジルイノシトール3-キナーゼ(PI3K)を阻害するWortmanninとLY294002は、AKTを含む下流の標的の活性化に必要なリン酸化現象を阻止することにより、C6orf103の活性に直接影響を与えることができる。この結果、ホスファチジルイノシトール(3,4,5)-三リン酸(PIP3)レベルが低下し、PI3K/ACT経路内でC6orf103が適切に機能するために不可欠となる。ラパマイシンは、mTORを阻害することにより、C6orf103が関与する細胞増殖や生存などのプロセスに影響を与え、間接的にその機能を阻害することになる。同様に、PD98059はMAPK/ERK経路の主要なキナーゼであるMEK1/2を標的としており、その阻害作用はこの経路に関連するC6orf103の機能にも及ぶ可能性がある。
SB203580やSP600125のようなさらなる阻害剤は、それぞれストレス活性化MAPキナーゼp38とJNKを標的とする。これらのキナーゼを阻害することによって、SB203580とSP600125はC6orf103の機能を抑制することができ、これらの経路によって媒介されるストレスに対する細胞応答に関与していると考えられる。Srcファミリーチロシンキナーゼに焦点を当てたPP2と、BCR-ABLとSrcキナーゼを標的とするダサチニブは、C6orf103の活性がこれらのキナーゼファミリーによって制御されている場合、どちらもC6orf103の機能を阻害することができる。EGFR阻害剤であるエルロチニブとゲフィチニブは、C6orf103の機能にとって重要なシグナル伝達を阻害し、その投与による活性の低下を示唆する。最後に、IC-87114とLY333531は、それぞれPI3KδとPKCβを選択的に阻害することで、これらの酵素が参加するシグナル伝達ネットワークにおけるC6orf103の役割に影響を与え、C6orf103の機能的活性の低下をもたらす可能性がある。
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