C4orf52アクチベーターという名称は、C4orf52遺伝子のタンパク質産物と特異的に相互作用する特殊な化合物群を指す。C4orf52という命名法は、この遺伝子が第4染色体に位置し、タンパク質に翻訳される可能性のあるDNAセグメントである「オープンリーディングフレーム(orf)」に分類されることを示唆している。52という名称は、この領域でカタログ化された特定のorfを意味する。ここでいう活性化因子とは、C4orf52タンパク質の活性を高める分子のことで、発現に影響を与えたり、安定性を高めたり、他の細胞成分との相互作用を促進したりする可能性がある。このような活性化因子の活性は、C4orf52の機能を理解することが前提であり、そのことがこのタンパク質の活性を増強するような相互作用をする分子をデザインする指針になるであろう。
C4orf52活性化因子を開発するためには、このタンパク質の構造と細胞内での役割に関する基礎的な理解が不可欠である。もしタンパク質の立体構造がわかれば、活性化物質となりうる低分子の結合部位が明らかになるだろう。そのためには、X線結晶構造解析、クライオ電子顕微鏡、核磁気共鳴分光法などの詳細な構造解析技術が必要となる。潜在的な結合部位が同定されれば、これらの部位と相互作用する化合物について、化学ライブラリーをスクリーニングすることができる。この最初のスクリーニングでは、通常、何千もの化合物がC4orf52タンパク質に結合し、その活性を調節する能力をテストするハイスループットアッセイが行われる。これらのスクリーニングから同定されたリード化合物は、その後、タンパク質の機能を調節する特異性と有効性を高めるために最適化の段階に入る。メディシナルケミストは、生物学的アッセイと計算モデリングから得られた結果に基づいて、これらの化合物の化学構造を繰り返し修正し、化合物の構造の変化がC4orf52タンパク質との相互作用にどのような影響を与えるかを予測する。このような研究の最終的な目標は、C4orf52活性化物質として、C4orf52タンパク質の機能的活性を高めることに成功した最適化された化合物のコレクションを作り出すことである。
| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $41.00 $132.00 $214.00 $500.00 $948.00 | 119 | |
PKC活性化剤として、PMAはシグナル伝達経路を調節し、SMIM20のような膜タンパク質の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
β-Mercaptoethanol | 60-24-2 | sc-202966A sc-202966 | 100 ml 250 ml | $90.00 $120.00 | 10 | |
酸化ストレスを誘導し、膜タンパク質を含む細胞ストレス応答に関与するタンパク質の発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | 67-68-5 | sc-202581 sc-202581A sc-202581B | 100 ml 500 ml 4 L | $31.00 $117.00 $918.00 | 136 | |
しばしば溶媒として使用されるDMSOは、細胞の透過性とストレスに影響を与え、膜タンパク質の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Tunicamycin | 11089-65-9 | sc-3506A sc-3506 | 5 mg 10 mg | $172.00 $305.00 | 66 | |
N-結合型グリコシル化の阻害剤であり、ERストレスを引き起こし、SMIM20のような膜タンパク質の発現を調節する可能性がある。 | ||||||
Thapsigargin | 67526-95-8 | sc-24017 sc-24017A | 1 mg 5 mg | $136.00 $446.00 | 114 | |
SERCAポンプ阻害剤で、ERストレスを誘導し、積分膜タンパク質を含む様々なタンパク質の発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Dexamethasone | 50-02-2 | sc-29059 sc-29059B sc-29059A | 100 mg 1 g 5 g | $91.00 $139.00 $374.00 | 36 | |
グルココルチコイドとして、多くの細胞経路を調節し、ある種の膜タンパク質の発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Autophagy Inhibitor, 3-MA | 5142-23-4 | sc-205596 sc-205596A | 50 mg 500 mg | $65.00 $261.00 | 113 | |
オートファジー阻害剤であり、細胞の恒常性に影響を与え、ストレス応答の一部として膜タンパク質の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Sodium (meta)arsenite | 7784-46-5 | sc-250986 sc-250986A | 100 g 1 kg | $108.00 $780.00 | 3 | |
酸化ストレスとヒートショック応答を誘導し、これらの経路に関与するタンパク質の発現を変化させる可能性がある。 | ||||||