スタウロスポリンは広範なキナーゼ阻害剤であり、C11orf1の活性化や安定化に必要なリン酸化を阻害する可能性がある。 同様に、シクロヘキシミドによるタンパク質合成の阻害は、C11orf1と相互作用したり、C11orf1の機能に必要なタンパク質のレベルを低下させる可能性がある。ラパマイシンやブレフェルジンAのような化合物は、それぞれタンパク質合成や輸送に重要な経路を阻害することにより、C11orf1の活性に不可欠なプロセスを破壊する可能性がある。
PD98059、SP600125、SB203580、U0126のような阻害剤は、MEK、JNK、p38 MAPKのようなMAPKシグナルカスケードの特定の構成要素を標的とする。このことは、C11orf1がMAPK経路の一部であるか、あるいはMAPK経路によって制御されている場合、これらの阻害剤がその活性を低下させる可能性を示唆している。さらに、MG132やボルテゾミブのようなプロテアソーム阻害剤は、タンパク質の蓄積や細胞ストレスにつながる可能性があり、もしC11orf1がプロテオスタティックなメカニズムによる制御を受けているならば、C11orf1の活性を阻害するかもしれない。一方、2-デオキシ-D-グルコースはC11orf1の機能的活性に必要なエネルギー供給を減少させる可能性がある。最後に、シクロスポリンAはカルシニューリンの阻害を通して脱リン酸化過程に影響を与えることにより、C11orf1の活性を調節するかもしれない。
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