H2AヒストンファミリーメンバーL3の化学的活性化剤、例えばトリコスタチンA、SAHA、ニコチンアミド、バルプロ酸、酪酸ナトリウム、MS-275、スクリプタイド、RGFP966、PCI-34051、パノビノスタット、ベリノスタット、モセチノスタットは、主にヒストン脱アセチル化酵素(HDAC)の阻害を介して機能する。これらの化学物質によるHDACの阻害は、H2AヒストンファミリーメンバーL3を含むヒストンのアセチル化レベルの上昇をもたらす。H2AヒストンファミリーメンバーL3のアセチル化は、クロマチン構造を緩和し、より転写活性の高い状態を可能にする重要な調節修飾である。この修飾は、転写装置がDNAにアクセスし、遺伝子の転写を促進するために不可欠である。
トリコスタチンAやSAHAなどの化学物質は、HDACを広く標的とすることが知られており、それによって他のヒストンタンパク質の中でもH2AヒストンファミリーメンバーL3のアセチル化を増加させる。一方、PCI-34051のような化合物は、HDAC8を特異的に阻害するという、より標的を絞ったアプローチをとるが、それでもH2AヒストンファミリーメンバーL3のアセチル化は亢進する。その特異性にかかわらず、結果としてクロマチンランドスケープが変化し、H2AヒストンファミリーメンバーL3が活性化される。この活性化によって、よりオープンで遺伝子発現に寛容なクロマチンコンフォメーションが促進される。これらの化学活性化因子の作用に一貫したテーマは、クロマチン構造の調節におけるヒストンアセチル化の極めて重要な役割であり、それによって転写活性化因子や遺伝子発現に必要な他の因子のアクセス性を制御している。
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