Hnf4aosとしても知られるノンコーディングRNA遺伝子0610008F07Rikは、ハツカネズミ(Musculus)の遺伝子発現を支配する複雑な制御ネットワークの重要な担い手として同定された。この遺伝子は、肝臓の発育と肝機能全般に重要な核内受容体タンパク質である肝核因子4α(HNF4α)の制御に複雑に関与している。0610008F07Rikの発現は肝臓や腎臓などの臓器で顕著に高く、これらの組織内で起こる生理学的プロセスに特化した役割を担っていることが示唆される。この遺伝子自体はタンパク質をコードしていないが、代わりにノンコーディングRNAを産生する。このRNAは、制御タンパク質の分子シンクとしての働き、クロマチン構造の改変、メッセンジャーRNAの安定性と翻訳の変化など、他の遺伝子の制御において多様な役割を果たすことができる。
0610008F07Rikのような遺伝子の発現がどのように制御されるかを理解するために、間接的ではあるが、阻害剤として機能する可能性のある様々な化学物質が同定されている。5-アザシチジンやトリコスタチンAのような化合物は、エピジェネティック・マシーナリーの広範な側面を標的とし、それぞれDNAの脱メチル化とヒストンのアセチル化を変化させる。アクチノマイシンDのような他の化学物質は、転写機構を直接阻害し、ゲノム全体のRNA合成を減少させる手段を提供する。ノンコーディングRNAのカテゴリーに特化すると、α-アマニチンがRNAポリメラーゼIIを強力に阻害することで、ncRNA転写物のレベルを低下させることができる。同様に、シグナル伝達経路を標的とする低分子阻害剤、例えばシロリムス、LY294002、PD98059、SP600125などは、細胞の増殖と分化に関与する主要なキナーゼを阻害することにより、遺伝子発現に影響を与える能力を示す。これらの阻害剤は、広範囲の細胞標的に作用する一方で、ncRNAレベルを規定するシグナル伝達経路や転写制御機構を破壊することにより、0610008F07Rikの発現を選択的にダウンレギュレートする可能性を示唆している。このような化学物質と遺伝子の相互作用の微妙な理解を通して、研究者たちは細胞機能における0610008F07Rikの役割をさらに解明していくことになるだろう。
関連項目
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
5-アザシチジンは、複製中のDNAに取り込まれ、遺伝子制御領域の脱メチル化を引き起こすことで、0610008F07Rikの発現をダウンレギュレートし、転写のサイレンシングにつながる可能性があります。 | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
トリコスタチンAはヒストン脱アセチル化酵素活性を阻害することで0610008F07Rikの転写を抑制し、クロマチン構造が開いた状態となり、クロマチン構造の維持ができないために転写が抑制される可能性があります。 | ||||||
RG 108 | 48208-26-0 | sc-204235 sc-204235A | 10 mg 50 mg | $128.00 $505.00 | 2 | |
RG108は、DNAメチルトランスフェラーゼを阻害することで0610008F07Rikの発現を低下させ、遺伝子サイレンシングと関連するマーカーである遺伝子のプロモーター領域のメチル化を減少させる可能性がある。 | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
アクチノマイシンDはDNAにインターカレートすることによって0610008F07Rikの転写を阻害することができ、それによってDNA鋳型に沿ってRNAポリメラーゼが進むのを妨害する。 | ||||||
α-Amanitin | 23109-05-9 | sc-202440 sc-202440A | 1 mg 5 mg | $260.00 $1029.00 | 26 | |
α-アマニチンは、mRNA、snRNA、およびいくつかのmiRNAを転写する酵素であるRNAポリメラーゼIIを特異的に阻害することによって、0610008F07Rikのレベルを低下させる可能性がある。 | ||||||
Rapamycin | 53123-88-9 | sc-3504 sc-3504A sc-3504B | 1 mg 5 mg 25 mg | $62.00 $155.00 $320.00 | 233 | |
ラパマイシン(シロリムス)は、いくつかの細胞タンパク質やncRNAの合成に重要なmTOR経路を阻害することにより、0610008F07Rikの発現をダウンレギュレートすることができた。 | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
レチノイン酸は、ビタミンAの活性代謝物として、レチノイン酸受容体に結合し標的遺伝子の転写を変化させることで、0610008F07Rikの転写を減少させる可能性があります。 | ||||||
Chloroquine | 54-05-7 | sc-507304 | 250 mg | $68.00 | 2 | |
クロロキンは、エンドソームの酸性化とオートファジープロセスを阻害することで、0610008F07Rikの発現を減少させる可能性があり、細胞の恒常性と遺伝子発現プロファイルの変化につながる。 | ||||||
(±)-JQ1 | 1268524-69-1 | sc-472932 sc-472932A | 5 mg 25 mg | $226.00 $846.00 | 1 | |
JQ1は、BETタンパク質のブロモドメインに競合的に結合することで、0610008F07Rikのダウンレギュレーションにつながる可能性があります。これにより、クロマチンからそれらを排除し、それらの制御下にある遺伝子の発現を抑制します。 | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $121.00 $392.00 | 148 | |
LY 294002 は、細胞シグナル伝達経路の主要なキナーゼである PI3K を標的とすることで 0610008F07Rik の発現を阻害し、下流の転写活性を低下させる可能性がある。 | ||||||