TTF/Transcription Termination Factor/TTF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-407927

概要

TTF1（transcription termination factor 1；TTFCとも呼ばれる）は核小体に局在するDNA結合タンパク質で、RNAポリメラーゼIによる転写終結を調節するとともに、rDNAクロマチンの組織化や核小体の構築にも寄与します。リボソームDNA反復配列内の特定の終結エレメントに結合することで、TTF1はrDNA座位における複製や修復イベントとrRNA合成の協調を助け、リボソーム生合成やプロテオスタシスに影響を与えます。Pol I転写および核小体機能の制御異常は増殖ストレスの特徴の一つであり、がん遺伝子シグナル、ゲノム不安定性、細胞老化との関連で頻繁に研究されています。そのためTTF1は、核小体の恒常性、転写制御、細胞周期チェックポイント応答を結び付ける経路において、よく解析対象となります。

TTF/Transcription Termination Factor/TTF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるTTF1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、TTF1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、TTF1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、TTF/Transcription Termination Factor/TTF1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、TTF/Transcription Termination Factor/TTF1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、TTF1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• TTF/Transcription Termination Factor/TTF1の機能に不可欠なTTF1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、TTF1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• TTF/Transcription Termination Factor/TTF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびTTF/Transcription Termination Factor/TTF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、TTF1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  TTF/Transcription Termination Factor/TTF1 HDRプラスミド（h）および TTF/Transcription Termination Factor/TTF1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはTTF1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のTTF1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。