TADA2B Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406224

Panoramica

TADA2B (adattatore trascrizionale 2B) è un componente centrale del complesso ATAC con attività di acetiltransferasi degli istoni, che supporta l’avvio della trascrizione promuovendo l’acetilazione dell’istone H3 e mantenendo la cromatina accessibile. Attraverso interazioni con GCN5/KAT2A e moduli coattivatori correlati, TADA2B collega il rimodellamento della cromatina ai programmi di espressione genica dipendenti dalla RNA polimerasi II. La sua attività è collegata alla regolazione della progressione del ciclo cellulare, a reti trascrizionali associate alla differenziazione e alla funzione degli enhancer a livello dell’intero genoma. Un’alterata regolazione dei componenti dell’asse ATAC/GCN5, incluso TADA2B, è stata associata a una trascrizione deregolata e a stati epigenetici anomali osservati in studi sul cancro e in ambito neuro-sviluppativo.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO TADA2B (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene TADA2B in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del TADA2B insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto TADA2B a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina TADA2B.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di TADA2B per lo studio della segnalazione di TADA2B, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni TADA2B critici per la funzione di TADA2B
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di TADA2B per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal TADA2B CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal TADA2B CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus TADA2B. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal TADA2B Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR TADA2B (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia TADA2B per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio TADA2B definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.