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PSR Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-401718-ACT | 20 µg | $397.00 |
JMJD6 umano, noto anche come PSR, codifica un enzima contenente il dominio Jumonji C (JmjC) implicato nella regolazione epigenetica e nei processi associati all’RNA dell’espressione genica. È stato riportato che JMJD6 catalizzi l’idrossilazione e la demetilazione di substrati proteici e che interagisca con l’allungamento trascrizionale e lo splicing del pre‑mRNA tramite interazioni con BRD4 e fattori dello spliceosoma. Attraverso queste attività, PSR contribuisce al controllo della cromatina su programmi di sviluppo, progressione del ciclo cellulare e reti trascrizionali di risposta allo stress. Un’espressione o un’attività disregolata di JMJD6 è stata associata a stati trascrizionali alterati osservati in molteplici contesti patologici, rendendolo un bersaglio utile per studi meccanicistici sulla segnalazione della cromatina e sull’elaborazione dell’RNA.
PSR Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di JMJD6 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
PSR Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus JMJD6 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione JMJD6, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di PSR. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus JMJD6 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da PSR nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via PSR nelle cellule tumorali con espressione di JMJD6 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.