LOC147645 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406583

Panoramica

VSIG10L (LOC147645) codifica una proteina prevista contenente un dominio V-set e domini di tipo immunoglobulinico, che ci si aspetta si localizzi sulla superficie cellulare e partecipi alle interazioni cellula–cellula o cellula–matrice. In base all’architettura dei domini e all’omologia con altri membri della superfamiglia delle immunoglobuline, VSIG10L è implicato nei programmi di adesione epiteliale e nella regolazione dell’architettura tissutale, processi che si intrecciano con la differenziazione, la funzione di barriera e le reti di segnalazione coinvolte nella migrazione. Le variazioni di espressione di proteine correlate con domini Ig sono frequentemente associate a interazioni alterate con il microambiente tumorale e a caratteristiche metastatiche, rendendo VSIG10L un potenziale bersaglio per studi meccanicistici in biologia del cancro e nel rimodellamento epiteliale. L’analisi funzionale di LOC147645 può quindi chiarire i pathway che regolano la segnalazione dipendente dall’adesione e la plasticità fenotipica cellulare.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO LOC147645 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene VSIG10L in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del VSIG10L insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto VSIG10L a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina LOC147645.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di VSIG10L per lo studio della segnalazione di LOC147645, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni VSIG10L critici per la funzione di LOC147645
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di VSIG10L per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal LOC147645 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal LOC147645 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus VSIG10L. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal LOC147645 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR LOC147645 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia VSIG10L per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio VSIG10L definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.