GATA-6 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-420498

Panoramica

Il gene murino **Gata6** codifica il fattore di trascrizione a dita di zinco **GATA-6**, un regolatore chiave della specificazione delle linee endodermiche e della differenziazione epiteliale durante l’embriogenesi e l’omeostasi dei tessuti nell’adulto. GATA-6 modula programmi genici che controllano le decisioni di destino cellulare, la morfogenesi e lo sviluppo degli organi, inclusi processi nei sistemi respiratorio e gastrointestinale. Si integra con reti trascrizionali dello sviluppo e con vie di segnalazione quali **WNT**, **BMP/TGF-β** e **FGF** per coordinare output trascrizionali dipendenti dal contesto. Un’attività di GATA-6 deregolata è stata collegata ad anomalie dello sviluppo e a stati di differenziazione alterati, rilevanti per la modellazione di difetti congeniti e per lo studio dei meccanismi di rimodellamento tissutale associati a malattia.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO GATA-6 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Gata6 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Gata6 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Gata6 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina GATA-6.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Gata6 per lo studio della segnalazione di GATA-6, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Gata6 critici per la funzione di GATA-6
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Gata6 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal GATA-6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal GATA-6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Gata6. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal GATA-6 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR GATA-6 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Gata6 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Gata6 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.