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BORIS Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-403313-ACT | 20 µg | $397.00 |
CTCFL codifica BORIS (Brother of the Regulator of Imprinted Sites), una proteina legante il DNA del gruppo cancer-testis, correlata a CTCF, che riconosce sequenze di tipo isolatore e rimodella l’architettura della cromatina. BORIS partecipa alla regolazione epigenetica della trascrizione modulando l’attività di promotori/enhancer, gli stati di metilazione del DNA e l’organizzazione del genoma di ordine superiore, influenzando processi quali l’espressione dei geni della linea germinale, i programmi di destino cellulare e l’accessibilità della cromatina. Un’espressione aberrante di BORIS è associata a riprogrammazione trascrizionale e a un’espressione deregolata di reti germinali normalmente silenziate e di reti oncogeniche, rendendolo un bersaglio utile per studiare la plasticità epigenetica e i meccanismi di controllo trascrizionale nelle cellule umane.
BORIS Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di CTCFL senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
BORIS Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus CTCFL nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione CTCFL, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di BORIS. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus CTCFL nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da BORIS nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via BORIS nelle cellule tumorali con espressione di CTCFL silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.