TRM61 Inibitori

Gli inibitori comuni della TRM61 includono, ma non solo, la Sinefungina CAS 58944-73-3, la 5-Azacitidina CAS 320-67-2, l'Omocisteina CAS 6027-13-0, la 5′-Deossi-5′-metiltioadenosina CAS 2457-80-9 e la 5-Aza-2′-Deossicitidina CAS 2353-33-5.

Gli inibitori di TRM61 si riferiscono a una classe di composti in grado di inibire indirettamente l'attività della proteina TRM61, una subunità del complesso tRNA metiltransferasi. Questi inibitori agiscono mirando a varie fasi del processo di modificazione del tRNA o interferendo con il meccanismo generale di metilazione all'interno della cellula. I composti elencati non sono inibitori diretti della TRM61, ma possono influenzare la funzione della proteina alterando la disponibilità del substrato o inibendo le attività enzimatiche correlate.

Composti come l'adenosina periodato e la 5-azacitidina possono modificare il substrato (tRNA) in modo tale da alterarne il riconoscimento da parte di TRM61, impedendo una corretta metilazione. Sinefungin e Neplanocin A sono analoghi nucleosidici che inibiscono gli enzimi metiltransferasi in senso lato, che possono includere enzimi come TRM61. SAH e MTA sono inibitori a feedback; sono prodotti o sottoprodotti della reazione di metilazione che possono inibire le metiltransferasi, compresa la TRM61, occupando il sito attivo dell'enzima. Altri composti, come BIX-01294 e RG108, sono noti per inibire le metiltransferasi del DNA e, data la somiglianza dei meccanismi catalitici, potrebbero inibire anche le metiltransferasi dell'RNA. La decitabina e la zebularina sono analoghi della citidina che possono incorporarsi nell'RNA e nel DNA, inibendo potenzialmente i processi di metilazione in generale, che possono influenzare indirettamente l'attività di TRM61. Inoltre, composti come la 3-Deazaneplanocina A inibiscono l'enzima S-adenosilomocisteina idrolasi, portando all'accumulo di SAH, un forte inibitore del prodotto delle metiltransferasi, inibendo così l'attività di TRM61. La cicloleucina può inibire la sintesi di S-adenosilmetionina (SAM), il donatore primario di metile per le reazioni di metilazione, influenzando l'attività di metilazione di TRM61.