Gli inibitori chimici della SerpinA3m utilizzano una serie di meccanismi per ridurre la capacità della proteina di interagire con le proteasi e di inibirle, che è la sua funzione biologica principale. Il diflunisal ottiene l'inibizione legandosi alla SerpinA3m e stabilizzandola in una conformazione inattiva, impedendo alla proteina di svolgere efficacemente il suo ruolo. Analogamente, si ritiene che il fenilbutazone induca un cambiamento conformazionale nella SerpinA3m, ostacolando la sua capacità di legare le proteasi. Al contrario, il sulfisoxazolo compete con la SerpinA3m per il legame con la proteasi, riducendo così l'attività inibitoria della proteina. Questa inibizione competitiva fa sì che SerpinA3m sia meno in grado di interagire con i suoi bersagli proteasici. La benzamidina agisce in modo simile, competendo con le proteasi che SerpinA3m inibisce, diminuendo indirettamente l'attività della proteina.
Altri inibitori, come il blu di metilene, disturbano la funzione della SerpinA3m alterando il suo stato redox, fondamentale per mantenere la conformazione attiva della proteina. L'acido ellagico e l'epigallocatechina gallato si legano direttamente alla SerpinA3m e possono ostruire il sito attivo della proteina o alterarne la struttura, causandone l'inibizione. La clorochina interferisce con la glicosilazione della SerpinA3m, impedendo il corretto ripiegamento e la funzione della proteina. I restanti composti -protinina, nafamostat, gabexate e camostat - sono tutti inibitori della serina proteasi che inibiscono indirettamente la SerpinA3m legandosi alle proteasi che la SerpinA3m normalmente inibisce. In questo modo, questi inibitori riducono il numero di bersagli proteici disponibili per SerpinA3m, attenuando così la sua capacità di sopprimere l'attività delle proteasi. Ciascuna di queste sostanze chimiche, attraverso le loro distinte interazioni con SerpinA3m o con i suoi bersagli proteasici, diminuisce efficacemente l'azione inibitoria di SerpinA3m.
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