Gli inibitori chimici di NWD1 funzionano alterando il paesaggio epigenetico all'interno delle cellule, principalmente attraverso l'inibizione delle istone deacetilasi (HDAC). La tricostatina A, il Vorinostat, il Panobinostat, la Romidepsina, l'Acido Valproico, l'Entinostat, il Belinostat, il Quisinostat, la Tacedinalina, il Mocetinostat, la Chidamide e il Givinostat condividono un meccanismo comune: inibiscono le HDAC, enzimi che rimuovono i gruppi acetilici dalle proteine istoniche, determinando una struttura cromatinica più condensata e una ridotta espressione genica. Inibendo le HDAC, queste sostanze chimiche aumentano l'acetilazione degli istoni, promuovendo così una struttura cromatinica più aperta che può portare a modelli di espressione genica alterati. Di conseguenza, l'espressione di NWD1 viene inibita perché la sintesi della proteina è regolata direttamente dall'accessibilità del suo gene nella struttura cromatinica.
L'inibizione delle HDAC porta a un aumento dell'acetilazione degli istoni, che modifica l'interazione tra DNA e istoni, influenzando l'accesso del macchinario trascrizionale al DNA. Questo cambiamento nella struttura della cromatina può inibire la trascrizione dei geni, compresi quelli che codificano per NWD1. La tricostatina A e il Vorinostat, ad esempio, sono noti per causare l'accumulo di istoni acetilati, che possono sopprimere l'espressione di geni specifici, come NWD1. Analogamente, Panobinostat e Romidepsin funzionano accumulando istoni acetilati nella cromatina, con conseguente repressione dell'espressione genica, tra cui NWD1. Anche gli altri inibitori HDAC elencati, come l'acido valproico e l'entinostat, determinano un aumento dell'acetilazione degli istoni, inibendo così la NWD1, sebbene la loro selettività e potenza possano variare.
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