HMGN3 Inibitori
I comuni inibitori dell'HMGN3 includono, ma non solo, la tricostatina A CAS 58880-19-6, la mitramicina A CAS 18378-89-7, la clorochina CAS 54-05-7, la chinomicina A CAS 512-64-1 e la pentamidina CAS 100-33-4.
Gli inibitori chimici di HMGN3 possono esercitare i loro effetti attraverso vari meccanismi, che portano tutti all'inibizione funzionale del ruolo di questa proteina nel rimodellamento della cromatina e nella regolazione trascrizionale. La tricostatina A, ad esempio, è un inibitore dell'istone deacetilasi in grado di aumentare l'acetilazione degli istoni, che a sua volta può contrastare gli effetti di condensazione della cromatina esercitati da HMGN3, inibendone l'attività. Analogamente, la mitramicina A, legandosi a sequenze ricche di GC nel DNA, può spostare l'HMGN3 dai suoi siti di legame preferenziali ai nucleosomi, inibendone così la funzione. La capacità della clorochina di intercalarsi nel DNA interrompe il legame di HMGN3 ai nucleosomi, ostacolando la sua capacità di influenzare la struttura e la funzione della cromatina. L'echinomicina, legandosi al DNA in corrispondenza delle sequenze CpG, impedisce a HMGN3 di associarsi alle sequenze di DNA bersaglio sui nucleosomi, ostacolandone la funzione. Inoltre, la pentamidina e la netropsina hanno come bersaglio rispettivamente le regioni ricche di AT e i solchi minori del DNA e il loro legame può competere con HMGN3 per i siti di legame del DNA, inibendo potenzialmente la sua capacità di legare la cromatina.
Inoltre, la Distamicina, legandosi a sequenze ricche di AT nel solco minore del DNA, può impedire le interazioni di HMGN3 con questi siti, inibendo il suo ruolo nel rimodellamento della cromatina. La cromomicina A3 si lega a sequenze di DNA ricche di GC, che potrebbero occupare i siti di legame al DNA per HMGN3 e quindi inibire la sua funzione modulatoria sulla cromatina. Il mitoxantrone e la daunorubicina si intercalano nel DNA, interrompendo potenzialmente l'interazione di HMGN3 con i nucleosomi e inibendo il suo ruolo nella modificazione della struttura cromatinica. L'actinomicina D, legandosi al DNA nel complesso di iniziazione della trascrizione, può inibire le interazioni tra il DNA e HMGN3. Infine, l'inibizione della DNA girasi e della topoisomerasi II da parte della Novobiocina può alterare la struttura della cromatina in modo da diminuire il legame favorevole di HMGN3, inibendo così la sua capacità di modulare l'espressione genica attraverso il rimodellamento della cromatina.
| Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
|---|---|---|---|---|---|---|
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
La tricostatina A è un inibitore dell'istone deacetilasi. L'HMGN3 modula la struttura e la funzione della cromatina legandosi ai nucleosomi, alterando l'acetilazione degli istoni e l'accesso ai fattori di trascrizione. Inibendo l'istone deacetilasi, la tricostatina A può aumentare l'acetilazione dell'istone, che può contrastare gli effetti di condensazione della cromatina di HMGN3, inibendo così funzionalmente la sua attività nel rimodellamento della cromatina. | ||||||
Mithramycin A | 18378-89-7 | sc-200909 | 1 mg | $54.00 | 6 | |
La mitramicina A si lega alle sequenze ricche di GC nel solco minore del DNA. L'HMGN3 si lega preferenzialmente ai nucleosomi in prossimità di regioni trascrizionalmente attive, spesso arricchite da sequenze GC. Legandosi a queste sequenze, la mitramicina A può spostare l'HMGN3 dai suoi siti di legame preferenziali, inibendo così il ruolo dell'HMGN3 nel favorire gli stati di cromatina trascrizionalmente attivi. | ||||||
Chloroquine | 54-05-7 | sc-507304 | 250 mg | $68.00 | 2 | |
La clorochina è nota per la sua capacità di intercalare il DNA, che può interrompere le interazioni DNA-proteine. Questa intercalazione può ostacolare il legame di HMGN3 ai nucleosomi, inibendo così la sua capacità di influenzare la struttura della cromatina e la regolazione trascrizionale. | ||||||
Quinomycin A | 512-64-1 | sc-202306 | 1 mg | $163.00 | 4 | |
La chinomicina A è un bisintercalatore che si lega al DNA in corrispondenza delle sequenze CpG. Poiché è stato dimostrato che l'HMGN3 lega i nucleosomi con un'affinità per alcune sequenze di DNA, il legame dell'echinomicina potrebbe impedire all'HMGN3 di associarsi alle sequenze di DNA bersaglio sui nucleosomi, inibendo così la sua funzione. | ||||||
Pentamidine | 100-33-4 | sc-208158 sc-208158A | 25 mg 50 mg | $373.00 $557.00 | ||
La pentamidina è un agente che si lega alle regioni ricche di AT del solco minore del DNA. Legandosi a queste regioni, la pentamidina potrebbe competere con HMGN3 per i siti di legame del DNA, inibendo potenzialmente la capacità di HMGN3 di legarsi alla cromatina e di esercitare i suoi effetti biologici sulla struttura e sulla funzione della cromatina. | ||||||
Chromomycin A3 | 7059-24-7 | sc-200907 | 10 mg | $255.00 | ||
La cromomicina A3 si lega a sequenze del DNA ricche di GC e ha dimostrato di inibire le interazioni tra proteine e DNA. Questo legame può inibire l'associazione di HMGN3 con la cromatina occupando i siti di legame del DNA con cui HMGN3 interagirebbe normalmente, inibendo così la sua capacità di modulare la struttura della cromatina. | ||||||
Mitoxantrone | 65271-80-9 | sc-207888 | 100 mg | $279.00 | 8 | |
Il mitoxantrone si intercala nel DNA e può interrompere le interazioni DNA-proteine. Questa intercalazione potrebbe inibire l'interazione di HMGN3 con i nucleosomi, potenzialmente inibendo il ruolo di HMGN3 nel rimodellamento della cromatina e nella regolazione trascrizionale. | ||||||
Daunorubicin hydrochloride | 23541-50-6 | sc-200921 sc-200921A sc-200921B sc-200921C | 10 mg 50 mg 250 mg 1 g | $103.00 $429.00 $821.00 $1538.00 | 4 | |
La daunorubicina si intercala nel DNA e può inibire il legame di HMGN3 ai nucleosomi, inibendo così la sua funzione di modifica della struttura della cromatina. | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
L'actinomicina D si lega al DNA nel complesso di iniziazione della trascrizione e può inibire le interazioni tra il DNA e le proteine che lo legano. Questa inibizione può estendersi a HMGN3, impedendo il suo legame con la cromatina e quindi inibendo il suo ruolo nell'organizzazione della cromatina e nella regolazione trascrizionale. | ||||||
Novobiocin | 303-81-1 | sc-362034 sc-362034A | 5 mg 25 mg | $96.00 $355.00 | ||
La novobiocina è un inibitore della DNA girasi e della topoisomerasi II, enzimi coinvolti nel superavvolgimento del DNA e nella dinamica della cromatina. Inibendo questi enzimi, la Novobiocina potrebbe alterare la struttura della cromatina in un modo meno favorevole al legame di HMGN3, inibendo così il ruolo funzionale di HMGN3 nel rimodellamento della cromatina e nella regolazione dell'espressione genica. | ||||||