Gli inibitori chimici di H2BFWT agiscono principalmente interrompendo il processo di deacetilazione degli istoni, che è un passaggio fondamentale nella regolazione della struttura della cromatina e dell'espressione genica. Gli inibitori dell'istone deacetilasi, come la tricostatina A, il mocetinostat, il panobinostat, il vorinostat, l'entinostat, la romidepsina, il belinostat, il CUDC-101, l'acido valproico, il quisinostat, il givinostat e la chidamide, aumentano il livello di acetilazione delle code degli istoni, determinando una conformazione più aperta della cromatina. Questo stato della cromatina può interferire con la normale funzione di H2BFWT, che è coinvolto nell'impacchettamento del DNA nei nucleosomi e nella regolazione dell'espressione genica. L'aumento dei livelli di acetilazione che risulta dall'azione di questi inibitori può ostacolare la capacità di H2BFWT di condensare correttamente la cromatina, che è fondamentale per il controllo dei processi trascrizionali.
Mantenendo gli istoni in uno stato iperacetilato, questi inibitori chimici possono ostacolare l'interazione tra H2BFWT e altre proteine e con il DNA stesso, portando a una compromissione della capacità di rimodellamento della cromatina. Ad esempio, la tricostatina A e il Vorinostat possono determinare una struttura della cromatina meno favorevole alla compattazione, un processo vitale per la repressione trascrizionale dei geni. Anche la romidepsina, un peptide ciclico, e il belinostat, un idrossamato, possono portare a un accumulo di istoni acetilati, influenzando così il ruolo di H2BFWT nella dinamica della cromatina. Inoltre, composti come il CUDC-101, con la sua azione inibitoria multitarget, possono aumentare i livelli di acetilazione degli istoni e, grazie a questa azione, interrompere la funzionalità di H2BFWT all'interno della cromatina. Il tema costante di queste sostanze chimiche è la loro capacità di alterare il paesaggio epigenetico modulando lo stato di acetilazione degli istoni, che a sua volta modula i ruoli strutturali e regolatori di H2BFWT all'interno della cromatina. Questo meccanismo fa sì che l'attività di H2BFWT sia funzionalmente ridotta.
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