Os inibidores químicos da H2BFWT actuam principalmente através da perturbação do processo de desacetilação das histonas, que é um passo fundamental na regulação da estrutura da cromatina e da expressão genética. Os inibidores da histona desacetilase, tais como a tricostatina A, o mocetinostato, o panobinostato, o vorinostato, o entinostato, a romidepsina, o belinostato, o CUDC-101, o ácido valpróico, o quisinostato, o givinostato e a chidamida, elevam o nível de acetilação nas caudas das histonas, conduzindo a uma conformação mais aberta da cromatina. Este estado da cromatina pode interferir com a função normal da H2BFWT, que está envolvida no empacotamento do ADN em nucleossomas e na regulação da expressão genética. Os níveis elevados de acetilação que resultam da ação destes inibidores podem obstruir a capacidade da H2BFWT para condensar corretamente a cromatina, o que é fundamental para o controlo dos processos de transcrição.
Ao manterem as histonas num estado hiperacetilado, estes inibidores químicos podem impedir a interação entre a H2BFWT e outras proteínas, bem como com o próprio ADN, conduzindo a uma capacidade de remodelação da cromatina comprometida. Por exemplo, a Tricostatina A e o Vorinostat podem resultar numa estrutura de cromatina menos propícia à compactação, um processo vital para a repressão transcricional dos genes. A romidepsina, um péptido cíclico, e o belinostato, um hidroxamato, podem igualmente conduzir a uma acumulação de histonas acetiladas, afectando assim o papel da H2BFWT na dinâmica da cromatina. Além disso, compostos como o CUDC-101, com a sua ação inibidora multiobjectivo, podem elevar os níveis de acetilação das histonas e, por esta ação, podem perturbar a funcionalidade da H2BFWT na cromatina. O tema consistente entre esses produtos químicos é a sua capacidade de alterar a paisagem epigenética, modulando o estado de acetilação das histonas, que por sua vez modula os papéis estruturais e reguladores do H2BFWT dentro da estrutura da cromatina. Este mecanismo assegura que a atividade do H2BFWT é reduzida funcionalmente.
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