LY294002 è un composto che interferisce con la via PI3K/AKT, una via centrale di trasduzione del segnale che regola la crescita e la sopravvivenza delle cellule, e che potrebbe downregolare le proteine attivate da questa via. SB431542 agisce sulla via TGF-β, implicata nella differenziazione e nella proliferazione cellulare, alterando potenzialmente la funzione delle proteine all'interno di questa rete di segnalazione. PD98059 e U0126 sono entrambi inibitori di MEK e potrebbero quindi ostacolare le proteine a valle della via MAPK/ERK, che è fondamentale per la divisione e la differenziazione cellulare. La rapamicina è un inibitore di mTOR e potrebbe influenzare le proteine coinvolte nella sintesi proteica, nella crescita cellulare e nell'autofagia, mentre la triciribina ha come bersaglio specifico AKT e potrebbe avere un impatto sulla segnalazione della sopravvivenza cellulare. Il PP2, in quanto inibitore delle chinasi della famiglia Src, potrebbe influenzare diverse proteine coinvolte nella trasduzione del segnale relativo alla crescita e alla differenziazione cellulare.
SP600125 inibisce JNK, che è coinvolto nelle risposte allo stress cellulare, influenzando potenzialmente qualsiasi proteina regolata da segnali di stress o infiammatori. Y-27632, inibendo ROCK, potrebbe avere un impatto sulla forma e sulla motilità delle cellule e forse sulle proteine che interagiscono con il citoscheletro. La dorsomorfina, come inibitore dell'AMPK, potrebbe alterare l'attività di proteine coinvolte nelle vie metaboliche e nel bilancio energetico. Il BAPTA-AM, chelando il calcio intracellulare, potrebbe influenzare le proteine che dipendono dal calcio, mentre l'MG132, un inibitore del proteasoma, potrebbe impedire la degradazione delle proteine, influenzando così potenzialmente il turnover proteico complessivo, compreso C2orf55.
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