Il processo di identificazione di questi attivatori inizia con un approccio meticoloso che prevede uno screening high-throughput (HTS). In questa fase, ampie librerie di entità chimiche vengono meticolosamente testate in saggi cellulari progettati per rilevare l'aumento dell'attività del gene. Questi saggi sono costruiti ingegnosamente collegando il promotore del gene a un sistema di segnalazione, come marcatori fluorescenti o luminescenti, in grado di indicare i livelli di espressione del gene. Un composto in grado di attivare il gene 2010309E21Rik porterà a un aumento del segnale del reporter, rendendo possibile quantificare il grado di attivazione. Dopo aver identificato i potenziali attivatori attraverso l'HTS, essi vengono sottoposti a rigorosi saggi di validazione per accertarne la specificità e l'efficacia nell'upregolazione del gene 2010309E21Rik. La reazione a catena della polimerasi quantitativa (qPCR) viene impiegata per misurare i livelli di mRNA del gene dopo l'interazione con questi composti chimici, fornendo dati quantitativi sulla loro influenza sull'espressione genica a livello trascrizionale. Un aumento significativo dei livelli di mRNA dopo l'applicazione è indicativo dell'attivazione trascrizionale.
Inoltre, l'impatto dell'attivazione sulla sintesi proteica viene valutato con la tecnica del Western blot. Questo metodo consente di rilevare e quantificare la proteina codificata dal gene 2010309E21Rik. Un aumento concordante dei livelli di mRNA e di proteina in seguito all'interazione con un composto è una conferma convincente del ruolo del composto come attivatore. Questi metodi di validazione non solo sono fondamentali per confermare i risultati dell'HTS iniziale, ma forniscono anche una comprensione dettagliata del meccanismo con cui questi attivatori esercitano il loro effetto sull'espressione del gene.
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| Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
|---|---|---|---|---|---|---|
Ionomycin, free acid | 56092-81-0 | sc-263405 sc-263405A | 1 mg 5 mg | $96.00 $264.00 | 2 | |
La ionomicina è uno ionoforo di calcio che aumenta le concentrazioni di calcio intracellulare. Questo aumento del calcio può attivare le protein-chinasi calcio-dipendenti o altre proteine che legano il calcio, il che potrebbe potenziare indirettamente l'attività del 2010309E21Rik se è calcio-dipendente. | ||||||
PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $41.00 $132.00 $214.00 $500.00 $948.00 | 119 | |
Il PMA è un analogo del diacilglicerolo (DAG) che attiva la protein chinasi C (PKC). La PKC fosforila le proteine bersaglio, il che può portare al potenziamento dell'attività di 2010309E21Rik se è regolata dalla fosforilazione mediata da PKC. | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $66.00 $325.00 $587.00 $1018.00 | 28 | |
L'acido retinoico agisce legandosi ai suoi recettori nucleari (RAR e RXR), che regolano l'espressione genica. Se 2010309E21Rik è sotto il controllo regolatorio dei geni che rispondono all'acido retinoico, la sua attività potrebbe essere indirettamente potenziata. | ||||||
Adenosine 3′,5′-cyclic monophosphate | 60-92-4 | sc-217584 sc-217584A sc-217584B sc-217584C sc-217584D sc-217584E | 100 mg 250 mg 5 g 10 g 25 g 50 g | $116.00 $179.00 $265.00 $369.00 $629.00 $1150.00 | ||
Il dibutirril cAMP è un analogo del cAMP permeabile alle cellule che attiva la PKA. Questa attivazione può portare alla fosforilazione delle proteine e potenzialmente migliorare l'attività di 2010309E21Rik se è un substrato della PKA. | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $43.00 $73.00 $126.00 $243.00 $530.00 $1259.00 | 11 | |
L'EGCG è noto per inibire alcune protein-chinasi. Se 2010309E21Rik è regolato negativamente da una chinasi inibita dall'EGCG, la sua attività potrebbe essere potenziata indirettamente dalla riduzione della fosforilazione inibitoria. | ||||||
D-erythro-Sphingosine-1-phosphate | 26993-30-6 | sc-201383 sc-201383D sc-201383A sc-201383B sc-201383C | 1 mg 2 mg 5 mg 10 mg 25 mg | $165.00 $322.00 $570.00 $907.00 $1727.00 | 7 | |
S1P attiva i recettori S1P, che possono innescare cascate di segnalazione intracellulare, compresa la via PI3K/Akt. Se l'attività di 2010309E21Rik è potenziata dalla segnalazione PI3K/Akt, S1P potrebbe aumentare indirettamente la sua attività. | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $123.00 $400.00 | 148 | |
LY294002 è un inibitore di PI3K. Se 2010309E21Rik fa parte di una cascata di segnalazione che è regolata negativamente dall'attività di PI3K, l'inibizione con LY294002 potrebbe eliminare questa regolazione negativa e potenziare l'attività di 2010309E21Rik. | ||||||
Oligomycin A | 579-13-5 | sc-201551 sc-201551A sc-201551B sc-201551C sc-201551D | 5 mg 25 mg 100 mg 500 mg 1 g | $179.00 $612.00 $1203.00 $5202.00 $9364.00 | 26 | |
L'oligomicina inibisce l'ATP sintasi, portando ad un aumento dell'ADP intracellulare. Se 2010309E21Rik richiede ADP o è regolato da sensori dello stato energetico cellulare, l'oligomicina potrebbe potenziare l'attività di 2010309E21Rik indirettamente. | ||||||
Zinc | 7440-66-6 | sc-213177 | 100 g | $48.00 | ||
Il cloruro di zinco può modulare l'attività di varie proteine zinc finger e dei metalloenzimi. Se 2010309E21Rik possiede un dominio che lega lo zinco o è regolato da proteine sensibili allo zinco, lo ZnCl2 potrebbe aumentare la sua attività. | ||||||
NAD+, Free Acid | 53-84-9 | sc-208084B sc-208084 sc-208084A sc-208084C sc-208084D sc-208084E sc-208084F | 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g 1 kg 5 kg | $57.00 $191.00 $302.00 $450.00 $1800.00 $3570.00 $10710.00 | 4 | |
Il NAD+ è un coenzima coinvolto nelle reazioni redox. Se 2010309E21Rik fa parte di percorsi regolati dal rapporto NAD+/NADH o se ha un'attività ADP-ribosiltransferasi, il NAD+ potrebbe potenziare la sua attività. | ||||||