SOBP CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-412439

Übersicht

SOBP (sine oculis-binding protein) ist ein nukleäres Protein, das an transkriptionellen Regulationsprogrammen beteiligt ist, die für die Entwicklung des Innenohrs und des sensorischen Systems erforderlich sind, und Funktionen bei der Festlegung von Zellschicksalen sowie der Gewebemusterbildung übernimmt. Humangenetische Befunde verknüpfen Loss-of-Function-Varianten in SOBP mit autosomal-rezessiver Taubheit und neuroentwicklungsbezogenen Phänotypen, was seine Bedeutung für die Ausbildung der Hörbahn und die neuronale Reifung unterstreicht. Eine Störung von SOBP ist daher relevant für die Untersuchung von genregulatorischen Netzwerken, die Differenzierung, Morphogenese und die Funktion sensorischer Organe koordinieren. In zellulären Modellen kann die Ausschaltung von SOBP genutzt werden, um nachgeschaltete transkriptionelle Antworten und entwicklungsbiologische Signalprozesse zu analysieren, die die Festlegung sensorischer Linien bestimmen.

Das SOBP CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des SOBP-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des SOBP-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von SOBP nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die SOBP-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von SOBP-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der SOBP-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf SOBP-Exone abzielen, die für die SOBP-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere SOBP-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom SOBP CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom SOBP CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des SOBP-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das SOBP HDR-Plasmid (h) und SOBP HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von SOBP-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten SOBP-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.