Plasmide CRISPR/Cas9 KO MARVELD1 (h): sc-413502

Présentation

MARVELD1 (MARVEL domain containing 1) code une petite protéine associée aux membranes, contenant un domaine MARVEL (MAL and related proteins for vesicle trafficking and membrane link), ce qui est compatible avec un rôle dans l’organisation des microdomaines membranaires et la régulation de la dynamique des protéines transmembranaires. Les fonctions rapportées relient MARVELD1 au contrôle des programmes d’adhérence, de prolifération et de différenciation cellulaires, avec des effets en aval sur les points de contrôle du cycle cellulaire et la signalisation sensible au stress. Une expression altérée de MARVELD1 a été observée dans de multiples contextes tumoraux et le gène est souvent étudié pour son association avec l’invasion, des phénotypes liés aux métastases et des réseaux de régulation transcriptionnelle. Ainsi, MARVELD1 constitue un nœud utile pour étudier la manière dont l’organisation membranaire s’articule avec des voies de signalisation qui influencent la plasticité cellulaire et des caractéristiques oncogéniques.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO MARVELD1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène MARVELD1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du MARVELD1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert MARVELD1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine MARVELD1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en MARVELD1 pour l'étude de la signalisation de MARVELD1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de MARVELD1 essentiels à la fonction de MARVELD1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de MARVELD1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le MARVELD1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le MARVELD1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus MARVELD1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le MARVELD1 plasmide HDR (h) et le MARVELD1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie MARVELD1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles MARVELD1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.