Plasmide CRISPR/Cas9 KO HoxC5 (h): sc-406548
- Espèces cibles: human
- 20 µg d'ADN plasmidique purifié et prêt à transfecter; Jusqu'à 20 transfections
- HoxC5 Le plasmide CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (h) est un ensemble de plasmides, chacun codant pour la nucléase Cas9 et un ARN guide (gRNA) de 20 nt spécifique à la cible, conçu pour une efficacité de knockout maximale à l'aide de séquences issues de la bibliothèque GeCKO v2
- Les séquences d'ARN guide (gRNA) dirigent Cas9 pour induire des cassures double brin (DSB) spécifiques au site dans le locus génomique HoxC5, entraînant un knock-out génique par jonction non homologue (NHEJ)
- Les gènes de résistance à la puromycine et RFP sont flanqués de sites LoxP, permettant la suppression des marqueurs de sélection via la recombinase Cre (Cre Vector : sc-418923) après l'établissement de lignées cellulaires knock-out stables
- Après transfection, l'efficacité de knockout de gène peut être évaluée par WB, IF ou IHC en utilisant l'anticorps: HoxC5 Antibody (1E10): sc-517171
Informations pour la commande
| Nom du produit | Ref. Catalogue | COND. | Prix HT | QTÉ | Favoris | |
Plasmide CRISPR/Cas9 KO HoxC5 (h) | sc-406548 | 20 µg | $397.00 |
Présentation
HOXC5 code le facteur de transcription HoxC5, une protéine à domaine homeobox se liant à l’ADN, qui contribue à la mise en place de l’axe antéro-postérieur et de l’identité régionale au cours du développement embryonnaire. Dans les tissus différenciés, HoxC5 peut influencer des programmes de spécification du destin cellulaire, de morphogenèse et de migration en régulant des réseaux transcriptionnels interagissant avec l’organisation de la chromatine et les voies de signalisation du développement. Des profils d’expression dérégulés des gènes HOX, dont HOXC5, ont été rapportés dans de nombreux types de tumeurs et sont fréquemment associés à des états de différenciation altérés, à une invasivité accrue et à un remaniement des programmes transcriptionnels. En tant que régulateur du développement, HOXC5 est également pertinent pour l’étude de l’engagement de lignée, de la plasticité épithélio-mésenchymateuse et de circuits de régulation génique dépendants du contexte.
Le plasmide CRISPR/Cas9 KO HoxC5 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène HOXC5 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du HOXC5, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.
La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert HOXC5 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine HoxC5.
Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en HOXC5 pour l'étude de la signalisation de HoxC5, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.
Caractéristiques principales
- sgRNA ciblant le ou les exons de HOXC5 essentiels à la fonction de HoxC5
Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de HOXC5 pour améliorer l'efficacité du knock-out
Compatible avec l'administration par transfection
Variantes de conception
CRISPR +/- HDR
- Les gRNA codés par le HoxC5 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le HoxC5 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus HOXC5. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
Les constructions donneuses HDR codées par le HoxC5 plasmide HDR (h) et le HoxC5 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie HOXC5 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles HOXC5 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.