HoxC5 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406548

Panoramica

HOXC5 codifica il fattore di trascrizione HoxC5, una proteina homeobox in grado di legare il DNA che contribuisce al patterning lungo l’asse antero-posteriore e all’identità regionale durante lo sviluppo embrionale. Nei tessuti differenziati, HoxC5 può influenzare programmi di specificazione del destino cellulare, morfogenesi e migrazione regolando reti trascrizionali che interagiscono con l’organizzazione della cromatina e con vie di segnalazione dello sviluppo. Profili di espressione deregolati dei geni HOX, incluso HOXC5, sono stati riportati in molteplici tipi di tumore e sono spesso associati a stati di differenziazione alterati, maggiore invasività e riprogrammazione trascrizionale. In quanto regolatore dello sviluppo, HOXC5 è inoltre rilevante per studiare l’impegno di linea, la plasticità epitelio-mesenchimale e circuiti di regolazione genica dipendenti dal contesto.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO HoxC5 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene HOXC5 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del HOXC5 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto HOXC5 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina HoxC5.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di HOXC5 per lo studio della segnalazione di HoxC5, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni HOXC5 critici per la funzione di HoxC5
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di HOXC5 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal HoxC5 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal HoxC5 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus HOXC5. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal HoxC5 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR HoxC5 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia HOXC5 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio HOXC5 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.