Plasmide CRISPR/Cas9 KO CD362/SDC2/Syndecan-2 (m): sc-420985

Présentation

Sdc2 code le syndécane‑2 (CD362/SDC2), un protéoglycane transmembranaire à héparane sulfate qui agit comme co‑récepteur des composants de la matrice extracellulaire et des facteurs de croissance se liant à l’héparine. En organisant les interactions entre protéoglycanes de surface cellulaire et ligands, SDC2 régule l’adhésion et la migration cellulaires ainsi que le remodelage du cytosquelette, et influence la signalisation via des voies telles que FGF, VEGF, Wnt et les réseaux intégrine/FAK–SRC. Dans les modèles murins, Sdc2 a été utilisé pour étudier la communication stroma–épithélium, les réponses angiogéniques et le remodelage tissulaire dans des modèles de développement et de lésion. Des altérations de l’expression ou de la glycosylation de SDC2 sont également étudiées dans le cadre de la fibrose et de la biologie du microenvironnement tumoral, où une signalisation dépendante de la matrice peut moduler la prolifération et l’invasivité.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO CD362/SDC2/Syndecan-2 (m) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène Sdc2 dans les lignées cellulaires mouse. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du Sdc2, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert Sdc2 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine CD362/SDC2/Syndecan-2.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en Sdc2 pour l'étude de la signalisation de CD362/SDC2/Syndecan-2, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de Sdc2 essentiels à la fonction de CD362/SDC2/Syndecan-2
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de Sdc2 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le CD362/SDC2/Syndecan-2 plasmide CRISPR/Cas9 KO (m) et le CD362/SDC2/Syndecan-2 plasmide CRISPR/Cas9 KO (m2) ciblent des sites distincts au sein du locus Sdc2. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le CD362/SDC2/Syndecan-2 plasmide HDR (m) et le CD362/SDC2/Syndecan-2 (m2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie Sdc2 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles Sdc2 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.