Dans le milieu cellulaire, l'activité de ZNF488 peut être modulée par diverses cascades de signalisation qui convergent vers la molécule de second messager qu'est l'AMPc. Les entités moléculaires qui augmentent les niveaux intracellulaires d'AMPc, soit par la stimulation directe de l'adénylyl cyclase, soit par l'inhibition des phosphodiestérases, peuvent potentiellement renforcer l'activité transcriptionnelle de ZNF488. Cette augmentation de l'AMPc s'accompagne souvent de l'activation de la protéine kinase A (PKA), qui peut phosphoryler une myriade de cibles en aval, y compris des facteurs de transcription susceptibles d'interagir avec ZNF488 ou ses éléments régulateurs, augmentant ainsi son activité fonctionnelle. En outre, les analogues de l'AMPc capables de traverser les membranes cellulaires peuvent également servir à activer directement la PKA, entraînant une cascade d'événements susceptibles de potentialiser l'activité de ZNF488, éventuellement en influençant l'état de phosphorylation ou les interactions protéine-protéine qui impliquent ZNF488 dans la régulation transcriptionnelle.
Au-delà de l'axe AMPc-PKA, certaines petites molécules ont été identifiées qui pourraient indirectement activer ZNF488 par d'autres voies. L'activation d'Epac, un facteur d'échange de guanine nucléotide, par des ligands spécifiques initie une voie de transduction du signal distincte aboutissant à l'activation de petites GTPases qui pourraient moduler l'activité de ZNF488. En outre, l'interférence avec la machinerie de synthèse des protéines par le biais de certains inhibiteurs peut déclencher des protéines kinases activées par le stress, qui peuvent influencer l'activité de ZNF488 dans le cadre d'une réponse cellulaire plus large aux facteurs de stress environnementaux.
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