Les inhibiteurs chimiques de WBSCR9 agissent par divers mécanismes pour inhiber son activité en perturbant les voies qui conduisent à son activation. La wortmannine et le LY294002 sont tous deux des inhibiteurs des phosphoinositides 3-kinases (PI3K), un activateur en amont de la voie de signalisation Akt qui est crucial pour la phosphorylation et l'activation subséquente de WBSCR9. En inhibant la PI3K, ces substances chimiques réduisent l'activité kinase de l'Akt, étape nécessaire à la phosphorylation de la WBSCR9. Sans cette phosphorylation, WBSCR9 reste dans un état d'inhibition fonctionnelle. De même, la Spautine-1 favorise la dégradation de PI3K, ce qui entraîne une diminution de l'activation de WBSCR9 médiée par Akt en raison de la réduction des niveaux de PI3K. Le MK-2206 adopte une approche plus directe en inhibant l'Akt de manière allostérique, empêchant ainsi la WBSCR9 d'être phosphorylée et activée.
Outre ces inhibiteurs de la voie PI3K-Akt, d'autres produits chimiques ciblent la voie mTOR, qui est également liée à l'activation de WBSCR9. La rapamycine, par exemple, inhibe la cible mammalienne de la rapamycine (mTOR), ce qui a un impact sur la signalisation Akt et, par conséquent, sur l'activité de WBSCR9. L'AZD8055 est un autre inhibiteur puissant de mTOR et, en entravant l'activité de mTOR, il supprime l'influence de la voie Akt sur WBSCR9. Palomid 529 et PF-04691502 perturbent tous deux la voie Akt/mTOR, empêchant ainsi la phosphorylation et l'activation de WBSCR9. La perifosine perturbe différemment la voie Akt en interférant avec la localisation membranaire de l'Akt, qui est nécessaire à son activation, ce qui entraîne une diminution de l'activité de WBSCR9. La triciribine inhibe spécifiquement l'activation de l'Akt, ce qui entraîne l'inhibition fonctionnelle de la WBSCR9. La miltefosine inhibe la phosphorylation de l'Akt et le GSK690693, en tant qu'inhibiteur pan-Akt, empêche l'activation de toutes les isoformes de l'Akt, ce qui inhibe largement l'activité des protéines en aval, y compris la WBSCR9. Chacun de ces inhibiteurs, en agissant à différents points des voies de signalisation, garantit que l'activation de WBSCR9 est effectivement empêchée.
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