L'activation moléculaire de l'UPRT repose sur un réseau complexe de voies de signalisation, dans lequel plusieurs petites molécules peuvent jouer un rôle essentiel. Les composés qui augmentent les niveaux intracellulaires d'AMP cyclique (AMPc) sont particulièrement influents, car l'AMPc agit comme un second messager activant des protéines kinases telles que la PKA. Lorsqu'elle est activée, la PKA peut phosphoryler diverses protéines, dont potentiellement l'UPRT, augmentant ainsi son affinité pour les substrats et renforçant son activité enzymatique. De même, l'inhibition des phosphodiestérases par certaines molécules peut empêcher la dégradation de l'AMPc et du GMP cyclique, ce qui conduit à leur accumulation à l'intérieur des cellules et à l'activation subséquente des voies qui régulent à la hausse l'activité de l'UPRT. Les analogues de l'AMPc perméables aux cellules stimulent directement ces voies, potentialisant encore l'activité de la PKA. En outre, l'inhibition des protéines tyrosine phosphatases par certains composés du vanadium entraîne une augmentation globale de la phosphorylation des protéines, ce qui peut également affecter l'état de phosphorylation et l'activité de l'UPRT.
D'autres activateurs agissent en modifiant l'environnement cellulaire plus large dans lequel l'UPRT opère. L'activation de la protéine kinase activée par l'AMP (AMPK) par des analogues nucléotidiques spécifiques a un impact sur diverses voies métaboliques et pourrait renforcer l'activité de l'UPRT par des effets allostériques ou par phosphorylation. La modulation de l'activité de la GSK-3 ou l'altération des états redox cellulaires par la supplémentation en coenzymes essentiels sont des mécanismes supplémentaires par lesquels l'activité de l'UPRT peut être indirectement influencée. En outre, l'activation de la protéine kinase C (PKC) ou la modulation des cascades de signalisation MAPK peuvent entraîner la phosphorylation et l'activation de l'UPRT dans le cadre de la réponse cellulaire à différents stimuli. Les inhibiteurs de l'histone désacétylase et certains composés naturels peuvent également modifier les schémas d'expression des gènes, ce qui peut entraîner une augmentation de l'activité de l'UPRT par le biais de modifications épigénétiques et de changements subséquents dans l'accessibilité de la chromatine.
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