Les inhibiteurs chimiques de Supt4h1 utilisent divers mécanismes pour entraver sa fonction dans l'élongation de la transcription. La trichostatine A et le SAHA (Vorinostat) sont des inhibiteurs d'histones désacétylases qui modifient l'état d'acétylation des histones, ce qui peut modifier la structure de la chromatine et, par conséquent, affecter les profils d'expression des gènes. Ces changements dans le paysage chromatinien peuvent avoir un impact indirect sur la fonctionnalité de Supt4h1 en modifiant la dynamique transcriptionnelle dans laquelle elle est impliquée. JQ1 et I-BET151, qui ciblent la famille BET de protéines à bromodomaine, obtiennent un résultat similaire en influençant l'accessibilité et le remodelage de la chromatine, affectant ainsi la machinerie transcriptionnelle dans laquelle Supt4h1 opère. Le flavopiridol, un inhibiteur de la kinase cycline-dépendante, entrave différemment l'élongation de la transcription en inhibant l'état de phosphorylation du domaine C-terminal de l'ARN polymérase II, qui est crucial pour le processus transcriptionnel que Supt4h1 facilite.
Poursuivant la perturbation des processus transcriptionnels, la cyclopamine agit en inhibant la voie de signalisation Hedgehog, qui est impliquée dans la régulation de l'expression des gènes et peut recouper le rôle de Supt4h1 dans l'élongation de la transcription. La rapamycine, connue comme un inhibiteur de mTOR, peut entraîner des changements dans la transcription et la synthèse des protéines, ce qui affecte indirectement Supt4h1 en modifiant la disponibilité ou l'activité de la machinerie transcriptionnelle. Les inhibiteurs du protéasome tels que le bortézomib et le MG-132 contribuent à l'accumulation de protéines mal repliées, qui peuvent exercer un stress cellulaire et potentiellement perturber la fonction des facteurs de transcription et des cofacteurs qui interagissent avec Supt4h1. Le pladiénolide B, un inhibiteur de l'épissage, cible le spliceosome, affectant indirectement le processus d'élongation de la transcription dans lequel Supt4h1 est engagé. Chacun de ces inhibiteurs chimiques, grâce à son mode d'action unique, peut contribuer à l'inhibition fonctionnelle de Supt4h1 dans la voie d'élongation de la transcription.
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