Inhibiteurs SMCR7

Les inhibiteurs courants du SMCR7 comprennent, entre autres, la wortmannine CAS 19545-26-7, la rapamycine CAS 53123-88-9, le LY 294002 CAS 154447-36-6, la trichostatine A CAS 58880-19-6 et le 2-désoxy-D-glucose CAS 154-17-6.

Les inhibiteurs de SMCR7 sont une classe de composés chimiques conçus pour cibler et inhiber spécifiquement l'activité de SMCR7, également connue sous le nom de Listerin E3 Ubiquitin Protein Ligase 1 (LTN1), une protéine impliquée dans le système ubiquitine-protéasome. SMCR7 joue un rôle dans la régulation du contrôle de la qualité des protéines au sein de la cellule, en particulier dans l'identification et le marquage des produits ribosomiques défectueux (DRiP) en vue de leur dégradation. Les inhibiteurs de SMCR7 se lient à la protéine et entravent son activité de ligase, empêchant ainsi l'ubiquitination des substrats qui sont normalement ciblés pour la dégradation. L'inhibition peut être obtenue en interférant directement avec le site actif de la SMCR7 où s'effectue le transfert d'ubiquitine ou en modifiant de manière allostérique la structure de la protéine afin de réduire son affinité pour l'ubiquitine ou les protéines substrats. Les interactions spécifiques entre les inhibiteurs de SMCR7 et leur cible peuvent impliquer une série de liaisons non covalentes, notamment des liaisons hydrogène, des interactions ioniques et des forces de van der Waals, chacune contribuant à la puissance et à la spécificité de l'inhibiteur.

La recherche et le développement d'inhibiteurs du SMCR7 nécessitent une connaissance approfondie de la structure et de la fonction de la protéine. Des techniques de biologie structurale telles que la cristallographie aux rayons X et la cryo-microscopie électronique sont utilisées pour obtenir une image à haute résolution de la SMCR7, révélant les contours de son domaine ligase, les sites de liaison du substrat et les régions qui se prêtent à la liaison des inhibiteurs. Grâce à ces informations structurelles, les chimistes peuvent concevoir des molécules qui s'adaptent précisément à ces régions, empêchant ainsi la protéine de remplir sa fonction naturelle.