Les activateurs SCML1 fonctionnent en grande partie grâce à leur influence sur les processus de remodelage de la chromatine. SCML1 fait partie du complexe Polycomb group (PcG), qui est directement impliqué dans la répression transcriptionnelle par le biais du remodelage de la chromatine. Ce complexe exerce sa fonction en modifiant la structure de la chromatine, et tout changement dans l'état de la chromatine peut directement influencer l'activité de SCML1. Par exemple, la trichostatine A, l'acide subéranilohydroxamique (SAHA), Scriptaid, Oxamflatin, MS-275, MC1568 et le butyrate de sodium, tous des inhibiteurs de la désacétylase des histones, favorisent l'acétylation des histones, ce qui conduit à un état chromatinien détendu qui peut renforcer l'activité fonctionnelle de SCML1. Dans le même ordre d'idées, le BIX-01294, un inhibiteur de l'histone méthyltransférase G9a, peut entraîner une diminution de la méthylation des histones, favorisant le remodelage de la chromatine et, par conséquent, améliorant l'activité fonctionnelle de SCML1.
Un deuxième groupe d'activateurs de SCML1, comprenant la 5-Azacytidine, la 5-Aza-2'-désoxycytidine et le RG108, sont des inhibiteurs de l'ADN-méthyltransférase. Ces composés provoquent une déméthylation de l'ADN, une autre forme de remodelage de la chromatine, qui peut renforcer l'activité fonctionnelle de SCML1. La mithramycine A, un antibiotique qui se lie à l'ADN, est un autre activateur du SCML1. En interférant avec la liaison des facteurs de transcription à l'ADN, elle modifie l'expression des gènes et peut indirectement activer SCML1.
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