Inhibiteurs RPB2

Les inhibiteurs courants de RPB2 comprennent, entre autres, la 5-azacytidine CAS 320-67-2, la trichostatine A CAS 58880-19-6, la mithramycine A CAS 18378-89-7, l'acide rétinoïque, tous les trans CAS 302-79-4 et la rapamycine CAS 53123-88-9.

Les inhibiteurs de RPB2 sont des composés chimiques qui ciblent et inhibent l'activité de la deuxième plus grande sous-unité de l'ARN polymérase II (Pol II), connue sous le nom de RPB2 (RpoB dans certains analogues procaryotes). L'ARN polymérase II est une enzyme cruciale impliquée dans la transcription de l'ADN en ARN messager (ARNm), jouant ainsi un rôle central dans l'expression des gènes. La sous-unité RPB2 contribue de manière significative au noyau catalytique de la Pol II et est essentielle à son bon fonctionnement, notamment en ce qui concerne la liaison à l'ADN et l'élongation de la transcription de l'ARN. L'inhibition de RPB2 affecte la stabilité et la dynamique conformationnelle de l'enzyme, ce qui peut bloquer la transcription à des étapes critiques. De nombreux inhibiteurs de RPB2 agissent en interagissant avec les sites actifs ou allostériques de la sous-unité, interférant avec son intégrité structurelle ou son affinité de liaison pour les acides nucléiques.Structurellement, les inhibiteurs de RPB2 peuvent être divers, possédant souvent des cadres moléculaires complexes qui leur permettent de s'insérer dans des poches de liaison spécifiques de l'enzyme. Ces inhibiteurs peuvent bloquer des interactions clés entre la Pol II et la matrice d'ADN ou empêcher le recrutement efficace des facteurs de transcription associés. Les inhibiteurs de RPB2 peuvent être très sélectifs, se liant uniquement à des sous-domaines particuliers de la sous-unité RPB2, ce qui peut entraîner des variations dans la puissance et le mécanisme d'inhibition en fonction de la structure de l'inhibiteur spécifique. Étant donné que RPB2 joue un rôle conservé dans la machinerie de transcription des eucaryotes, les inhibiteurs ciblant cette sous-unité constituent souvent des outils précieux pour l'étude des aspects fondamentaux de la régulation de la transcription, permettant aux chercheurs de disséquer le contrôle minutieux de l'expression des gènes et du traitement de l'ARN au niveau moléculaire. Ces études contribuent également à une meilleure compréhension des interactions enzyme-substrat et de la dynamique structurelle des grands complexes à plusieurs sous-unités comme l'ARN polymérase II.