Rab 39 Activateurs

Les activateurs Rab 39 courants comprennent, sans s'y limiter, le sel d'ammonium de Farnesyl pyrophosphate CAS 13058-04-3, le sel de géranylgeranylpyrophosphate triammonium CAS 6699-20-3, le sel disodique de Guanosine-5'-Triphosphate CAS 86-01-1, la Brefeldine A CAS 20350-15-6 et la L-α-Lécithine, jaune d'œuf, hautement purifiée CAS 8002-43-5.

Les activateurs chimiques de Rab 39 comprennent une variété de composés qui facilitent le rôle de la protéine dans le trafic intracellulaire en maintenant son état actif lié au GTP ou en améliorant ses modifications post-traductionnelles nécessaires pour une localisation et une fonction correctes. Par exemple, le GTPγS, un analogue non hydrolysable du GTP, favorise directement l'activation de Rab 39 en se liant à lui et en empêchant l'hydrolyse du GTP, maintenant ainsi Rab 39 dans sa forme active. Ce point est crucial, car les GTPases comme Rab 39 ont besoin de se lier au GTP pour être activées, et le GTPγS garantit que Rab 39 reste dans cet état, ce qui lui permet de remplir en permanence son rôle dans le transport vésiculaire. De même, le GTP lui-même, qui est le ligand naturel des GTPases, se lie à Rab 39 et induit le changement de conformation nécessaire à l'activation de la protéine. L'AlF4-, imitant le γ-phosphate du GTP, agit également pour stabiliser les GTPases dans leur forme active, ce qui maintient artificiellement Rab 39 active. De plus, les ions magnésium, essentiels à l'activation des GTPases, facilitent la liaison du GTP à Rab 39, permettant ainsi son activation.

En outre, les modifications lipidiques de Rab 39 sont essentielles à son activation et à son association membranaire. Le farnésyl pyrophosphate et le géranylgeranyl pyrophosphate servent de substrats aux enzymes qui catalysent l'ajout de groupes farnésyl et géranylgeranyl, respectivement, à Rab 39. Ces modifications sont nécessaires pour que Rab 39 s'ancre dans les membranes cellulaires et devienne fonctionnellement actif. La phosphatidylsérine, un phospholipide, aide à recruter Rab 39 sur les surfaces membranaires, ce qui est une condition préalable à son activité. En outre, le palmitoyl-CoA peut contribuer à la modification lipidique de Rab 39, facilitant son attachement aux membranes et son activation ultérieure. Le chlorure de lithium joue un rôle dans la prolongation de l'état actif de Rab 39 en inhibant les protéines activatrices de la GTPase (GAP), qui accélèrent normalement la conversion du GTP-Rab 39 actif en sa forme inactive liée au PIB. En inhibant les GAP, le chlorure de lithium garantit indirectement que Rab 39 reste actif pendant de longues périodes. Enfin, les inhibiteurs spécifiques des GAP peuvent également conduire indirectement à l'activation soutenue de Rab 39, car ils empêchent l'inactivation de la GTPase, permettant à Rab 39 de poursuivre sa fonction dans le trafic des vésicules.