Les inhibiteurs chimiques de PDZK7 servent à moduler son activité au sein de diverses voies de signalisation cellulaire. La staurosporine, un inhibiteur de protéine kinase à large spectre, peut perturber les processus de phosphorylation essentiels aux interactions de PDZK7 avec d'autres protéines. Le GW5074, qui cible spécifiquement la kinase c-Raf, peut entraver le fonctionnement de PDZK7 en bloquant les voies médiées par c-Raf dont PDZK7 peut dépendre. En outre, le SP600125, en inhibant la c-Jun N-terminal kinase (JNK), peut empêcher PDZK7 de s'engager dans les voies de signalisation JNK qui sont nécessaires à sa fonction ou à sa stabilité dans le contexte cellulaire.
D'autres effets inhibiteurs sur PDZK7 peuvent être obtenus avec LY294002 et Wortmannin, qui sont tous deux des inhibiteurs des phosphoinositides 3-kinases (PI3K). En ciblant PI3K, ces inhibiteurs peuvent interférer avec les cascades de signalisation qui régulent PDZK7. De même, U0126 et PD98059, en tant qu'inhibiteurs de l'enzyme MEK, peuvent perturber la voie MEK/ERK, ce qui est probablement pertinent pour la régulation du rôle de PDZK7 dans la cellule. Le SB203580, qui cible la MAP kinase p38, peut affecter PDZK7 en modifiant la voie de la MAPK p38. Des inhibiteurs comme le Lapatinib et l'Erlotinib, qui ciblent l'EGFR et l'HER2, peuvent inhiber PDZK7 en bloquant les voies de signalisation que ces récepteurs contrôlent et que PDZK7 peut utiliser. Enfin, PP2, un inhibiteur de kinases de la famille Src, et SU5402, un inhibiteur du FGFR1, peuvent supprimer l'activité de PDZK7 en bloquant la signalisation médiée par la kinase Src et le FGFR1, respectivement, dans laquelle PDZK7 peut être impliquée.
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