OR51S1 fonctionne grâce à une variété d'interactions moléculaires, chacune initiant une cascade de signalisation distincte aboutissant à l'activation de ce récepteur couplé à une protéine G (RCPG). Le benzaldéhyde s'engage avec OR51S1 en s'arrimant au site de liaison du récepteur, induisant une reconfiguration structurelle qui déclenche la transduction du signal, caractérisée par une augmentation des niveaux de calcium intracellulaire. L'eucalyptol et le géraniol suivent un schéma similaire, chaque molécule s'insérant précisément dans la poche de liaison de OR51S1, favorisant l'activation de la protéine G associée et initiant une cascade de signalisation. Le citronellal, l'alcool phénylique et l'acétate d'isoamyle agissent également en tant qu'agonistes OR51S1, chacun se liant à la région de liaison de l'odorant du récepteur, ce qui conduit à l'activation des voies de la protéine G en aval, sur laquelle l'activation de OR51S1 suit.
L'anisaldéhyde, le salicylate de méthyle et le cinnamaldéhyde activent OR51S1 en se liant au domaine spécifique du ligand du récepteur, ce qui déclenche une série d'événements intracellulaires impliquant les protéines G. Il en résulte un changement de la structure du récepteur, qui est alors plus ou moins bien adapté à l'odorat. Il en résulte un changement de conformation du récepteur et l'activation de OR51S1. De même, le menthol, l'éthylvanilline et le limonène servent d'activateurs d'OR51S1, chaque composé s'engageant dans le domaine de liaison au ligand du récepteur, initiant une voie de transduction du signal par l'activation de la protéine G, aboutissant à l'activation fonctionnelle d'OR51S1. Ces interactions moléculaires illustrent la diversité et la spécificité des moyens par lesquels différents produits chimiques peuvent déclencher l'activation d'OR51S1 par une liaison directe et des voies de transduction du signal médiées par la protéine G.
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