Les inhibiteurs chimiques de Mpa2l ciblent diverses voies de signalisation pour moduler l'activité de cette protéine. La staurosporine, un inhibiteur de protéine kinase à large spectre, peut perturber le processus de phosphorylation essentiel à la fonction de Mpa2l, entravant ainsi son activité. Le LY294002 et la Wortmannine, deux inhibiteurs de PI3K, peuvent empêcher l'activation de la voie Akt, entraînant une réduction de l'activité de Mpa2l en bloquant la signalisation nécessaire en aval. De même, PD98059 et U0126, qui inhibent MEK1/2 dans la voie MAPK/ERK, peuvent diminuer l'activité de Mpa2l en obstruant les voies de signalisation essentielles à sa fonction. SP600125 et SB203580 ciblent spécifiquement la JNK et la MAP kinase p38 dans la voie MAPK, respectivement, et peuvent inhiber Mpa2l en empêchant la propagation des signaux nécessaires à son activité.
En outre, la rapamycine, un inhibiteur de mTOR, peut inhiber Mpa2l en interrompant les voies de signalisation de mTOR sur lesquelles il s'appuie. Le Y-27632, qui inhibe la kinase ROCK, peut perturber les processus de signalisation de la voie Rho/ROCK qui régulent l'activité de Mpa2l. PP2, en tant qu'inhibiteur des tyrosines kinases de la famille Src, peut entraver l'activité kinase nécessaire à la fonction de Mpa2l. Le ZM-447439, un inhibiteur de la kinase Aurora, peut inhiber Mpa2l en perturbant les voies dépendantes de la kinase Aurora qui sont cruciales pour sa fonction. Enfin, le bortézomib, par son action en tant qu'inhibiteur du protéasome, peut bloquer les signaux de dégradation dépendant du système ubiquitine-protéasome sur lesquels repose la régulation de Mpa2l, inhibant ainsi son activité fonctionnelle.
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