Des composés comme le LY294002 et la wortmannine peuvent entraver la voie de signalisation PI3K/Akt, qui est essentielle à la survie et au métabolisme des cellules. Ce faisant, ces inhibiteurs peuvent indirectement affecter les protéines qui sont régulées par cette voie ou qui en dépendent. De même, U0126, PD98059 et SB203580 sont conçus pour cibler les kinases des voies MAPK/ERK et p38 MAP kinase, respectivement. Ces voies font partie intégrante de la croissance cellulaire, de la différenciation et de la réponse de l'organisme au stress et à l'inflammation.
Les inhibiteurs comme la rapamycine qui ciblent la signalisation mTOR, d'autre part, peuvent avoir un impact sur les processus cellulaires liés à la croissance et au métabolisme. Des agents tels que le SP600125, qui inhibe JNK, peuvent affecter l'apoptose et le système immunitaire en modulant l'activité des protéines impliquées dans ces processus. Le NF449, qui inhibe la sous-unité Gs-alpha, peut modifier la signalisation dépendante de l'AMP cyclique, et le BAPTA-AM, en chélatant le calcium intracellulaire, peut affecter divers processus dépendants du calcium. Le rôle de la thapsigargin dans la perturbation de l'homéostasie calcique par l'inhibition de la SERCA pourrait influencer de nombreuses voies de signalisation dépendantes du calcium. Enfin, le 2-Deoxy-D-glucose, en inhibant la glycolyse, peut altérer le métabolisme énergétique cellulaire, affectant potentiellement les protéines qui dépendent des voies métaboliques ou les régulent.
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