La forskoline et l'IBMX augmentent les niveaux d'AMPc, un second messager qui joue un rôle important dans la signalisation cellulaire, affectant ainsi l'état fonctionnel des protéines qui réagissent à l'AMPc. La génistéine et le PD98059, en interférant respectivement avec la signalisation de la tyrosine kinase et l'activité de la MEK, ont le potentiel de modifier l'activité des protéines au sein de ces voies.
LY294002 et Wortmannin sont des inhibiteurs de PI3K, perturbant une voie clé impliquée dans la régulation de la croissance et de la survie des cellules, ce qui peut avoir des implications importantes pour les protéines en aval de la signalisation PI3K/Akt. L'U0126 et le SB203580, en inhibant respectivement la MEK et la p38 MAPK, peuvent induire des changements dans les protéines régulées par les voies MAPK/ERK et p38 MAPK, qui sont essentielles pour contrôler la différenciation cellulaire, la prolifération et la réponse au stress. L'inhibition de la signalisation mTOR par la rapamycine peut affecter la synthèse des protéines et l'autophagie, modulant ainsi les protéines impliquées dans le métabolisme et la croissance cellulaires. Le KN-93, en ciblant CaMKII, peut influencer les protéines régulées par des processus dépendant du calcium et de la calmoduline. L'inhibition sélective de la sous-unité Gsα des protéines G par le NF449 peut avoir un impact sur les protéines régulées par la signalisation des récepteurs couplés aux protéines G.
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