Les inhibiteurs chimiques de LDLRAD4 agissent par divers mécanismes pour perturber la fonction de la protéine, qui est impliquée dans des processus tels que l'endocytose et le maintien de l'intégrité des radeaux lipidiques. Le GW4869, en tant qu'inhibiteur de la sphingomyélinase neutre, empêche la production de céramide, un composant essentiel au maintien structurel des radeaux lipidiques. La perturbation de ces radeaux par le GW4869 peut donc inhiber l'activité de LDLRAD4 qui dépend de domaines de radeaux lipidiques intacts. De même, la filipine III et la méthyl-β-cyclodextrine ciblent les radeaux lipidiques riches en cholestérol en se liant au cholestérol et en l'extrayant de la membrane plasmique, respectivement. Leur action compromet l'intégrité des radeaux et peut donc atténuer la fonction de LDLRAD4 associée à ces microdomaines. L'U18666A perturbe également la distribution du cholestérol, inhibant ainsi potentiellement LDLRAD4 en affectant les environnements lipidiques essentiels à son action.
Dynasore et Monodansylcadaverine se concentrent sur la machinerie endocytique en inhibant respectivement la dynamine et l'endocytose médiée par la clathrine. L'inhibition de la dynamine GTPase par le Dynasore empêche finalement la scission des vésicules recouvertes de clathrine de la membrane plasmique, ce qui peut inhiber la fonction de LDLRAD4 dans le trafic des vésicules. La monodansylcadavérine inhibe également l'endocytose médiée par la clathrine, ce qui affecte le rôle de LDLRAD4 dans ce processus d'absorption cellulaire. Pitstop 2 et Chlorpromazine agissent en bloquant la formation de puits recouverts de clathrine, Pitstop 2 inhibant directement l'interaction entre la clathrine et les protéines adaptatrices, et Chlorpromazine empêchant l'assemblage de la clathrine, les deux pouvant inhiber la fonction de LDLRAD4 au sein de ces structures. La liaison de la nystatine au cholestérol perturbe l'intégrité de la membrane, ce qui, comme les autres inhibiteurs ciblant le radeau lipidique, peut entraver l'activité de LDLRAD4. Enfin, l'inhibition des tyrosines kinases par la génistéine peut affecter la fonctionnalité de LDLRAD4 en modifiant l'état de phosphorylation des protéines qui régulent son activité, inhibant ainsi le rôle de LDLRAD4 dans les voies de signalisation cellulaires.
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